r语言怎么查看富集分析的数据

Python012

r语言怎么查看富集分析的数据,第1张

r语言怎么查看富集分析的数据

1.首先利用r语言的install中的packages方法,输入参数【xlsx】即可。

2.此时利用library(xlsx)语句,打开xlsx这个库。

3.此时通过read的xlsx语法就能读取某个文件夹下的Excel文件。

4.这个时候,我们按下回车,就能看到通过r语言读取excel的一批数据。

首先打开r语言的命令行编辑窗口

先以简单数据为例,在r命令行窗口输入如下代码

data_test<-data.frame(c1<-c(7,8,9,10,11,12),c2<-c(23,36,87,54,15,98),c3<-c(400,325,567,212,698,555));

attach(data_test);

pdf("c:/four.pdf",family="gb1");

plot(c1,c2);

dev.off();

detach(data_test);

完成上述代码后,会在对应的输入路径(这里是c:/)下生产此pdf格式文件(这里命名为one.pdf)。使用pdf阅读器打开此文件查看。

完成上述代码后,会在对应的输入路径(这里是c:/)下生产此pdf格式文件(这里命名为two.pdf)。使用pdf阅读器打开此文件查看。

首先,下载并安装好R软件。打开R软件,可以看到R软件主窗口。

2

为了方便编辑代码,一般不在主窗口直接输入程序。我们可以点击“文件——新建程序脚本”,出现R编辑器。我们将在此输入需要运行的命令。

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使用因子格式输入数据。这里输入两组数据,以便后面说明详细使用方法。

4

输入命令plot(x),表示绘制序列x的散点图。选中程序,右键,点击“运行当前行或选中代码”,运行程序。按F5键或者Ctrl+R键也可以实现。在图标显示框出现散点图了。

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输入命令plot(x,y),其中x表示自变量,y是因变量,生成y关于x的散点图。运行命令,即出现散点图。

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再增加一组数据,用coplot函数绘制多变量的散点图。coplot(x~m|y)表示在不同的y值下,x关于m的散点图。