案例演示 | R语言绘制热图代码

Python014

案例演示 | R语言绘制热图代码,第1张

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我们在分析了差异表达数据之后,经常要进行热图的可视化展示。

热图(Heat map) 是一个以 颜色 变化来显示数据的 矩阵 。虽然“热图”是一个新兴的词汇,但是用明暗的矩阵来标示元素的方法已经有超过一世纪的历史了。

热图源自于展示数据的平面图像,较大的数字以小的深灰色、黑色方格呈现,而较小的数字则以较亮的方格标示。如Toussaint Loua在1873年就曾使用这样的手法来绘制对 巴黎 各区的社会学统计。 [1] 彼得·斯伊斯在1957年时进行 群集分析 时也透过置换矩阵的行和列的方法将更相似的值标示在一起。雅克·贝尔坦也曾用过类似的方法标示出 累积量表 的资料。而将 阶层式分群法 加入到矩阵中的概念则是由罗伯特·F·林于1973年创造,他利用多次印刷堆叠出的字符来表示不同程度的灰色,将每个字符大小则视为一像素。利兰·威尔金森则是于1994年开发出了第一个能生成高分辨率的矩阵的计算机程序—SYSTAT。

软件设计师科尔马克·金尼则在1991年时注册了热图这个商标用以形容一种描绘金融市场信息的平面图形, [2] 但是取得了金尼发明的公司在2003年时不小心使得这个商标失效了 [3]

r语言编程的步骤?R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。

工具原料一台电脑下载完毕的R software

方法/步骤分步阅读

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安装完毕R语言,新建属于自己的R变成文件夹,然后 File ->Change Dir..,设置成自己的工作文件,自己工作空间将都会产生在这个文件夹下。

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然后Files - >New Script,打开新的脚本编辑,在这里键入自己代码,编辑。

在此模式下,摁F5键意味着执行这一行,当我们编辑很多行的时候,我们可以进行全选,然后摁下F5,这样就会执行所有行的代码。

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下面进行实战,我们下面将会用R语言画出一个简单房子,具体的代码含义不解释,推荐Manning出版的《R语言实战》,里面有大量的联系及讲解。

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选中,然后执行F5按键,R语言就会画出一个简单的房子,具体代码可以参见下图。

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总之,R语言是一个非常好的统计软件,在生物统计,金融统计中发挥着越来越多的作用,同时R语言作为一款开源软件,也被世界的R语言兴趣者优化着。

注意事项

R作为一款免费的软件,有时候即使编正确的情况下,仍然可能出现错误

软件的学习在于多联系

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