怎么解决呢?直接取对数吗?
如果对表达量去一下log10,发现10000变成了4,10变成了1,这样之前离散程度很大的数据就被集中了。
聚类分析中均一化是如何计算的?
表达矩阵每行数据的各个数值减去每行数据的均值,再除以每行数据的标准差。
详细的数据规范化(归一化)、及Z-score标准化可参考教程 https://blog.csdn.net/weixin_38706928/article/details/80329563
关于R环境搭建可参考教程, 【R语言入门】R语言环境搭建 -
绘制热图
通过一些数学函数,将原始值进行映射。该方法包括log、指数、正切等。当变量是正偏态分布的时候,选用log对数。是否取对数可根据自己的需求。
ps:生信小白一枚。内容仅供参考,和谐交流 ,欢迎大佬指导,也欢迎大家一起学习。
R是一套由数据操作、计算和图形展示功能整合而成的套件。包括:有效的数据存储和处理功能,一套完整的数组(特别是矩阵)计算操作符,拥有完整体系的数据分析工具,为数据分析和显示提供的强大图形功能,一套(源自S语言)完善、简单、有效的编程语言(包括条件、循环、自定义函数、输入输出功能)。
在这里使用环境(environment)是为了说明R的定位是一个完善、统一的系统,而非其他数据分析软件那样作为一个专门、不灵活的附属工具。