注意区分： 数据类型 和 数据组成类型（数据结构）
数据类型 ：整型、浮点型、字符型、布尔型（不同的语言不同的叫法）
数据结构 ：向量(c())、矩阵(matrix())、数组(array())、列表(list())
注意：这里把 数据框 单拿出来讲（因为它比较特殊）
接下来通过一个实例讲解一下 S4数据结构 。这是我采用clusterProfiler做KEGG富集分析时的一个结果，其采用 S4数据结构 形式存放：
R语言数据结构主要有以下四种：
四种数据结构，重点掌握 向量 和 数据框
判断数据结构的函数： class()
向量的详细讲解在上一篇文章，以下主要讲数据框，矩阵，列表：
以下大部分操作使用的数据框为df
几个重要的函数：查看数据框的行数和列数，行名和列名；以及单独查行的数量，列的数量
数据框取子集有几种方法 ： $ 符号，坐标，名字，逻辑值
在 [,] 里，行在前面（左边），列在后面（右边），行与列用逗号 , 隔开： [行,列]
中括号里的逗号，表示维度的分割
数据框按照逻辑值取子集，TRUE对应的行/列留下，FALSE对应的行/列去掉。
修改第二列的列名，就是修改列名这个向量的第二个元素
https://blog.csdn.net/weixin_39718006/article/details/110516670
后续的笔记会有详细介绍
矩阵不能用 $ 符号取子集
t()：转置函数，行与列的互换
as.data.frame()：转换，把矩阵变为数据框 ，用as.matrix()函数也能把数据框变为矩阵
聚类，相似的行，相似的列会聚在一起。热图自动聚类，行和列的相对位置发生了变化，只是列与列，行与行之间的变化规律。
![热图自动聚类]]( https://upload-images.jianshu.io/upload_images/17511166-f6e2432a04cffbbe.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240 )
热图默认聚类，修改参数，不让聚类，热图与表达矩阵对应。
默认的设置不符合自己的预期，可以子啊作者允许的范围内定义。
查看函数帮助文档，参考修改，达到自己的要求。
列表没有列名和行名，只有元素的名字。列表可以由数据框，矩阵，向量，单独的一个数字都可以组成。
列表没有行和列的概念，只有元素，取子集的两种方式： [[]] ， $ ，
$ 有两个作用：数据框取子集和列表取子集。在矩阵和向量里不能用 $ 。
用 class() 函数更能具体说明问题， 判断数据结构和数据类型
以上内容是听 生信技能树 小洁老师的 R语言线上课 ，根据自己的理解记录下来，小洁老师授课非常细心，对不同水平的同学都照顾到，并且补充很多技巧以及注意事项。
认识R语言的四种数据结构，小洁老师强调重点掌握向量和数据框，在实战中遇到很多数据结构都是数据框，表达矩阵可以转化为数据框，数据框的一列可以看做是一个向量。小洁老师把实战中会需要的操作融入到练习题，在实战中能联想起小洁老师讲过的知识点。
阵是一个二维数组，只是每个元素都拥有相同的模式（数值型、字符型或逻辑型）。可通过函数matrix()创建矩阵。一般使用格式为
其中vector包含了矩阵的元素，nrow和ncol用以指定行和列的维数，dimnames包含了可选
的、以字符型向量表示的行名和列名。选项byrow则表明矩阵应当按行填充（byrow=TRUE）
还是按列填充（byrow=FALSE），默认情况下按列填充
数组（array）与矩阵类似，但是维度可以大于2， 数组可通过array函数创建，形式如下：
myarray <- array(vector, dimensions, dimnames)
其中vector包含了数组中的数据，dimensions是一个数值型向量，给出了各个维度下标的最大
值，而dimnames是可选的、各维度名称标签的列表
由于不同的列可以包含不同模式（数值型、字符型等）的数据，数据框的概念较矩阵来说更
为一般。它与你通常在SAS、SPSS和Stata中看到的数据集类似。数据框将是你在R中最常处理的
数据结构
数据框可通过函数data.frame()创建
其中的列向量col1、col2、col3等可为任何类型（如字符型、数值型或逻辑型）。每一列的名
称可由函数names指定
每一列数据的模式必须唯一，不过你却可以将多个模式的不同列放到一起组成数据框。由于数据框与分析人员通常设想的数据集的形态较为接近，我们在讨论数据框时将交替使用术语列和
变量
类别（名义型）变量和有序类别（有序型）变量在R中称为因子（factor）。因子在R中非常重要，因为它决定了数据的分析方式以及如何进行视觉呈现
函数factor()以一个整数向量的形式存储类别值，整数的取值范围是[1...k]（其中k是名义型变量中唯一值的个数），同时一个由字符串（原始值）组成的内部向量将映射到这些整数上
对于字符型向量，因子的水平默认依字母顺序创建。这对于因子status是有意义的，因为
“Excellent”“Improved”“Poor”的排序方式恰好与逻辑顺序相一致。如果“Poor”被编码为
“Ailing”，会有问题，因为顺序将为“Ailing”“Excellent”“Improved”。如果理想中的顺序是“Poor” “Improved”“Excellent”，则会出现类似的问题。按默认的字母顺序排序的因子很少能够让人满意.
你可以通过指定levels选项来覆盖默认排序。例如：
各水平的赋值将为1=Poor、2=Improved、3=Excellent。请保证指定的水平与数据中的真实值
相匹配，因为任何在数据中出现而未在参数中列举的数据都将被设为缺失值。数值型变量可以用levels和labels参数来编码成因子。如果男性被编码成1，女性被编码成2，则以下语句
列表（list）是R的数据类型中最为复杂的一种。一般来说，列表就是一些对象（或成分，component）的有序集合
