R语言——列表

R语言——列表

前一段工作太忙了,终于又有时间来继续学习了 列表就是一些对象(或成分,component)的有序集合。列表允许整合若干(可能无关)对象到单个对象名下。也就是说,某个列表中,可能是托干个向量、矩阵、数据框,甚至是其他列表的组合。函数lis
Python170
R语言中的一致性检验丨数析学院

R语言中的一致性检验丨数析学院

在诊断试验中,研究者希望考察不同诊断方法在诊断结果上是否具有一致性,比如:不同医务工作者对同一组病人的诊断结果是否一致、不同的诊断方法对同一个样本或研究对象的化验结果是否一致等。Cohen 等提出用 Kappa 值作为评价一致性的指标,并得
Python140
R语言岭回归的自变量可以为名义变量吗,如果有怎么处理

R语言岭回归的自变量可以为名义变量吗,如果有怎么处理

ridge regression可以用来处理下面两类问题:一是数据点少于变量个数;二是变量间存在共线性。当变量间存在共线性的时候,最小二乘回归得到的系数不稳定,方差很大。这是因为系数矩阵X与它的转置矩阵相乘得到的矩阵不能求得其逆矩阵,而r
Python120
R语言Plot函数总结

R语言Plot函数总结

par(mfrow = c(n,m),mar = c(0,0,0,0),mai = c(0,0,0,0)) mar,mai参数主要是调节图形的margin的大小,顺序是下、左、上、右 R语言中,设置plot(x,y,'..
Python160
R语言初学笔记:差异表达基因

R语言初学笔记:差异表达基因

setwd("E:GSE25066")#环境设置 library(limma)#加载差异分析包limma #将分组文件加载到环境中,分组信息第一列为样本名,第二列为分组信息如“high”“low” targ
Python120
R语言-自定义函数

R语言-自定义函数

在R的基础包和扩展包中包含了很多强大的R函数。然而很多时候我们需要自己编写函数来实现特定的任务。 function_name为函数名;arg为形参;expr为函数体。 2.1 编制一个函数计算。 输入:参数n 输出:
Python150
r语言 length和ncol的区别

r语言 length和ncol的区别

a本身是一个矩阵,而定义dimnames=list()则表示其每一个元素都被命名且命名方式是列表(list),因此在调用a中的元素的时候可以调用a[]或者a[[]]都可以。a[]是调用a本身的第几个元素,a[[]]是命名中的第几个名字下的元
Python140
R语言常用函数(基本)

R语言常用函数(基本)

vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表data.frame:数据框 c:连接为向量或列表 sequence:等差序列 rep:重复 length
Python280
R语言的一些矩阵运算

R语言的一些矩阵运算

摘自: https:www.cnblogs.comyupeter007p5325575.html矩阵的存储默认是按列进行存储的 matrix (data = NA, nrow = 1, ncol = 1, byrow
Python100
R语言_list()函数用法

R语言_list()函数用法

列表是R语言中的对象,它包含不同类型的元素,比如 - 数字,字符串,向量和另一个列表等。一个列表还可以包含一个矩阵或一个函数作为它的元素。使用list()函数创建列表。 列表元素可以给定它们的名字并且可以使用这些名称来访问。 列表的
Python140
LMS算法与最陡下降法有何不同?

LMS算法与最陡下降法有何不同?

最陡下降法在迭代过程中与输入信号无关,不具有有对输入信号统计特性变化的自适应性,最陡下降法的互相关向量P和自相关矩阵R都是确定量,所以根据最陡下降法迭代式所得到的权向量w(n)也是确定的向量序列。所以,最陡下降法不是自适应算法。而LMS算法
Python160
R语言做主成分分析问题

R语言做主成分分析问题

princomp(x, cor = FALSE, scores = TRUE, covmat = NULL,         subset = rep_len(TRUE, nrow(as.matrix(x))), ...)当cor = T
Python150
R语言进行ssGSEA分析

R语言进行ssGSEA分析

先加载相关的package 然后提取想要的基因集,变成list 然后进行富集分析 需要注意的点: 1.expr输入的表达矩阵必须为:SummarizedExperiment或者SingleCellExperiment Exp
Python100
r语言安装mass包的代码

r语言安装mass包的代码

步骤如下:1、自动安装:需要联网,在R的控制台,输入install.packages("MASS")#安装MASS包。2、离线安装:下载你所需要的包文件到个人计算机目录中,打开R的菜单栏-&gtPackages-
Python110
R语言常用函数整理(基础篇)

R语言常用函数整理(基础篇)

R语言常用函数整理本篇是基础篇,即R语言自带的函数。 vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框 c:
Python150