R语言 RDA分析（去冗余物种）

R语言 RDA分析（去冗余物种）

也做了挺多次RDA分析，自己现在小结一下RDA分析流程： 就我个人而言，虚线前面都是不太经历的步骤，我一般不会主动删去样品的环境信息，因为我接触的菌群这块本来就没有什么多余的环境信息-_-||，所以我的重点放在怎么去除多余OTU或菌群上
Python200
如何用R语言绘制热图

如何用R语言绘制热图

# --enable-R-shlib 需要设置，使得其他程序包括Rstudio可以使用R的动态库# --prefix指定软件安装目录，需使用绝对路径.configure --prefix=homeehbioR3.4.0 --ena
Python670
r语言期末大作业用什么数据好

r语言期末大作业用什么数据好

r语言期末大作业用描述性统计数据好。根据查询相关资料信息，描述性统计：选择合适的方法对数据进行统计分析。包括对数值型和类别型属性的统计，并对分析结果进行图形化的展示。描述性统计分析要对调查总体所有变量的有关数据进行统计性描述，主要包括数据的
Python320
R语言对应分析

R语言对应分析

@[toc] Q型分析：样本之间的关系（聚类算法等） R型分析：变量之间的关系（主成分分析、因子分析等）。 有时候我们不仅要弄清样本之间和变量之间的关系，还要弄清 样本与变量之间的关系 ，而对应分析就是这样一种分析方法。（变量
Python180
R语言绘制二元聚类图

R语言绘制二元聚类图

R语言绘制二元聚类图说明之前使用k均值方法将数据划分到不同的簇中，但当变量个数大于2时，就无法在二维空间中展示数据聚类的过程，因此可以使用二元聚类图先将变量减少成两个主要成分，然后利用组件（诸如轴线和椭圆）来展示数据聚类的结果。操作载入包，
Python210
如何通过R语言进行dca排序

如何通过R语言进行dca排序

R语言中自带的排序函数 在R中，跟排序有关的函数主要有三个：sort()，rank()，order()。其中sort(x)是对向量x进行排序，rank()是求秩的函数，它的返回值是这个向量中对应元素的“排名”，order()的返回值是对
Python220
如何利用r软件进行微生物rda分析

如何利用r软件进行微生物rda分析

如果只有一个响应变量数据，而没预测器（解释变量），我们仅仅需要、也只能归纳这个变量的分布特征（如通过直方图、中值，标准差、四分位极差等）。如果有多个响应变量，依然没有解释变量，我们可以用排序（间接梯度分析）来分析数据，例如可以用主成分分析（
Python160
r语言可以完成生物信息哪些工作

r语言可以完成生物信息哪些工作

R可以完成：1、处理一些简单的有格式的文本数据，包括矩阵等2、画一些简单的统计图，比如直方图，箱线图等3、分析一些专门的数据，比如芯片数据，RNA-seq数据等4、画一些专业的图，比如热图之类的     ，即主坐标分析（Principa
Python310