《R语言4.0.4软件》百度网盘资源免费下载:
链接: https://pan.baidu.com/s/160twe4ScMvIbGm2TI_sjHw
?pwd=3ts7 提取码: 3ts7R语言4.0.4是一款专业的统计建模软件,与其它建模软件不同的是这款软件完全免费、开源,所以深受大家的青睐。R软件拥有数据存储和处理系统;数组运算工具(其向量、矩阵运算方面功能尤其强大);完整连贯的统计分析工具;优秀的统计制图等多种功能,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘。标准的安装文件身自身就带有许多模块和内嵌统计函数,安装好后可以直接实现许多常用的统计功能。
R语言帮助的使用
想要学好一门语言,灵活利用帮助也是高效学习的一种方法,R语言的帮助获取有哪些呢?
8个PDF文档
首先在RGui标签项“帮助”里面有8个文档,可以直接打开,不过是英文的,下面提到的R文档都是英文的哈哈,呵呵!
输入help.start(),点击回车键,打开网页获取帮助
如果没有反应,就把给出的网址复制下来在浏览器中打开。其实,这与右边区域帮助是一样的,直接看右面的就行了。
使用help(函数名、包名)
这里查看一下求和函数sum()的用法帮助。
对于特殊字符和保留关键字必须用引号(单双都行)括起来。
help('<')或者help('for')
当然了,如果输入错误,会有提示,学习语言时,要养成 学会看错误提示 的好习惯。
>help(package = data.table)
点击包名就会跳转到这个包的详细介绍页面。
使用?函数名,获得关于函数的解释
用?sum与上面一样的效果。对于特殊字符和保留关键字必须用引号(单双都行)括起来
?'<'或者?'for',就会有相应的帮助。
使用??函数名,获得包含该函数名的其它函数
比如??sum就会获得包含该函数名sum()的其它函数。
使用example(函数名)获取函数的案例并且自动运行。
“persp”是R语言三维图像绘制函数,执行
>example("persp")
只需根据向导按“Enter”键,会画出几个漂亮的图像
有没有觉得画的图很漂亮,R语言作为优秀的数据可视化工具,能画的图远不止这些,丰富的第三方包为R语言提供了强大的画图功能,后面会慢慢看到。
——“哈喽,能请教你一下怎样在R server中调用Linux下的工具?”
——“你为什么要这么做呢?”
——“我想把Linux工具输出的结果直接在R中分析,不想换来换去”
bedtools 是一个非常香的工具,几乎是人尽皆知,是一个强大的处理bed等文件的工具,正如其自己描述的一样: a powerful toolset for genome arithmetic 。bedtools目前只支持在Linux下以命令行的形式运行,所以我们经常会遇到上面的问题。
那么如何解决呢?给大家分享一个好物,既然我们不想在Linux下运行bedtools,那为什么不在R下运行呢?感谢 北卡罗来纳大学教堂山分校的Phanstiel Lab 给了我们这样的机会,开发出了R下的bedtools—— bedtoolsr 。 不过,有喜必有悲,看下面这句话:
bedtoolsr should work on any system with R and bedtools installed. It has been tested on macOS (version 10.14 "Mojave") and Linux (Ubuntu version 18.04). bedtools is not available for Windowshowever, you can either use a virtual machine or Windows Subsystem for Linux . In either case, R from the Windows side would not be able to access bedtools running on the Linux side, so R and bedtoolsr would also have to be installed on the Linux side.
bedtools intersect的功能不用多介绍,直接上图:
这不是和bedtools intersect功能选项几乎一模一样?
这里还是用官网的示例数据来做,主要是想输出有交集的染色体坐标区间及相交区域的大小:
更多的功能就待大家去探索了~把这个包支持的函数全部列在下面了,对应bedtools的工具找就好了!
今天又是摸鱼的一天!