如何用rstudio制作r语言包

Python027

如何用rstudio制作r语言包,第1张

有点复杂啊。。。这么短讲不清楚。。。我写的仅供参考,以R官网的说法为准。

一般先点右上角新建一个project(一般是new directory),类型是package,其他设置看自己喜好啦。然后要填写DESCRIPTION,比如作者、概述、包的版本、license、依赖哪些包、建议同时装哪些包……函数如果都是用R语言写的话(没有用C/C++/Fortran/……来实现部分功能),就把.R文件都放到R目录底下。帮助文档(就是可以用help(function)调出来的文档)我比较建议用roxygen2包来做,直接在.R文件里按照特定的格式写文档(去这个包的网站看一下格式),然后在包的目录底下在R里运行roxygen2::roxygenize(),就直接把文档写到man目录下了,顺便NAMESPACE也一块儿自动写了,之后要改文档的话重新运行就行了。

其他方面:vignnettes之类的文档去网上找吧(考虑一下用好一点的搜索引擎o(╯□╰)o),这方面有一大堆东西可以写,当然也可以不写。还可以在包里自带数据集:把数据放在data目录下,关于数据的文档也可以在.R文件里写然后roxygenize。如果要用其他语言实现部分功能的话,去R的官网看怎么弄吧,我没用过这么高级的功能o(╯□╰)o。我还看到网上说有个叫packrat的东西可以用,好像是把依赖的包一起打包进新的包里。我没用过。

全部写好之后最好测试一下,比如在自己电脑里装上这个包试试,还可以在cmd/shell里运行R CMD check path/to/package/directory自动测试这个包(貌似windows系统下要装Rtools还要调一下系统的路径才能这么用,自己找一下吧)。

总之不是一篇回答就能说清楚的o(╯□╰)o,我自己也是花了好长时间在网上搜才把之前的包搞定的。

另外,作为一个project,可以考虑用一些版本控制的软件来帮忙,比如git、svn。用git的话可以直接放到github上面,别人就可以直接用devtools包里的函数装啦~如果想传到CRAN或者Bioconductor的话,对包的功能、稳定性、文档等的要求会比较高,我从没想过弄这些。

1、通过选择菜单:

程序包->安装程序包->在弹出的对话框中,选择你要安装的包,然后确定。

2、使用命令

install.packages(package_name,dir)

package_name:是指定要安装的包名,请注意大小写。

dir:包安装的路径。默认情况下是安装在..\library 文件夹中的。可以通过本参数来进行修改,来选择安装的文件夹。

3、本地来安装

如果你已经下载的相应的包的压缩文件,则可以在本地来进行安装。请注意在windows、unix、macOS操作系统下安装文件的后缀名是不一样的:

1)linux环境编译运行:tar.gz文件

2)windows 环境编译运行 :.zip文件

3)MacOSg环境编译运行:.tgz文件

注:包安装好后,并不可以直接使用,如果在使用包中相关的函数,必须每次使用前包加载到内存中。通过library(package_name)来完成。 包安装后,如果要使用包的功能。必须先把包加载到内存中(默认情况下,R启动后默认加载基本包),加载包命令:

Library(“包名”)

Require(“包名”) 1、查看包帮忙

library(help=package_name)

主要内容包括:例如:包名、作者、版本、更新时间、功能描述、开源协议、存储位置、主要的函数

help(package = package_name)

主要内容包括:包的内置所有函数,是更为详细的帮助文档

2、查看当前环境哪些包加载

find.package() 或者 .path.package()

3、移除包出内存

detach()

4、把其它包的数据加载到内存中

data(dsname, package=package_name)

5、查看这个包里的包有数据

data( package=package_name)

6、列出所有安装的包

library()