1、只要命名不冲突放一个文件里面完全没问题,初始化代码用一个$(function(){...})包裹着就可以了；
2、不同的页面执行不同的逻辑代码块完全不冲突,关键是知道自己在做什么；
具体做法：
1）比如a.css,b.css,c.css,把里面的内容都复制到一个css中，main.css这样手动就可以合并
压缩的话，网上都有工具来压缩，直接百度 css压缩 就可以了
2）js大部分是可以直接和css一样手动合并，然后压缩的（压缩方法，和压缩css一样，百度去），不过要注意复制到文件时的顺序，和代码里面的一些规范，不要把依赖什么的搞混了；如果js文件非常多手动处理很麻烦的时候，可能需要借助工具来实现，你可以试着用前端的一些加载器（require,seajs）来做一些优化，达到按需加载的目的，推荐用seajs试试；自动压缩的话，可以用nodejs的grunt来压缩，很好用。
那就做好站内代码优化。seo优化工作中最基本一项是要看的懂网页代码，如果你不懂网页代码，这样的SEO就是个残废，这话一点不夸张，我们优化网页代码的时候要注意一下几点。
一、空格，空格在网页中站15%的比例，空格也是字符，空格字符最常出现在代码的开始和结束处，还有就是空行中。
解决方法：把代码放在Dreamweaver里全部选中代码然后按shift+tab键左对齐。
二、字体加粗标签。例如：与两者都是对字体加粗但是却比多了5个字符。要用简单的标签，减少请求次数，加快打开页面的速度!
三、不使用表格设计网页。目前基本上淘汰了表格在网页制作中的使用，因为他不如DIV打开速度快，表格是个淘汰的东西。
四、ALT图片描述。给网站上所有的图片加上ALT文字描述，因为图片蜘蛛看不懂图片内容，你要给图片加描述，这是SEO们常犯的小错误。如：<img alt="关键词（寿夫人）" src="地址XXX" />
五、CSS优化。把CSS样式写在网页的head头部标签里面，如果页面体积大的时候，可以把CSS写在文件里采取调用的方式。
六、CSS代码缩写。在CSS里面有不少可以缩写的属性，包括margin，padding，border，font，background和颜色值等。
七、代码压缩。当你决定把网站项目部署到网络上，那你就要考虑对CSS进行压缩，出去注释和空格，以使得网页加载得更快。压缩您的代码，可以采用一些工具，如YUI Compressor，利用它可精简CSS代码，减少文件大小，以获得更高的加载速度。
八、js文件调用。使用内部的JS文件调用，同时吧js放到最后前，可以加快打开页面速度!
总结：如何知道自己的网站代码是否符合SEO优化呢?使用百度站长工具给自己的网站进行检测，看评估的分值，把错的地方全部优化，直到检测出满分的效果，这都是一些细节工作。
