1在用户体验和表现上，原生APP胜出。在这个方面，HTML5仍然面临着不同移动终端设备本地浏览器的功能接入问题，同时在提供用户展示图形界面和数据展现的丰富性方面还有不足。
2在跨平台开发成本上，HTML5胜出。HTML5采用网络通用语言，不用考虑终端设备或者操作系统的不同。目前，W3C(万维网联盟World Wide Web Consortium，简称W3C)正在与汽车业、出版业、电视业进行讨论，将web引入新的设备平台中。随着平台逐渐丰富，这方面的成本问题将会日益凸显。
3在更快速的更新和更强的发布控制方面，HTML5胜出。与HTML5相比，原生APP不具备的一个优势就是开放性。HTML5是基于Web的，这就意味着没有一家公司可以成为市场的“看门人”，谷歌不行、苹果不行、亚马逊不行、三星也不行，没有看门人的存在，更新的速度就不会提升、应用的收入也不会受到削减。不过，在终端设备出现创新时，HTML5在新功能的支持上仍有些落后。
4在变现能力方面，原生APP胜出。原生应用的分发平台，如App Store和Google Play，目前是获得收入的较为成熟的商业模式而HTML5应用，除了付费下载以外，还没有形成其他成熟的商业模式。
5在技术人才储备上，HTML5胜出。HTML5、JavaScript和CSS都是Web常用语言然而，iOS工程师却是稀有资源，而且很贵……
对于碎片化挑战而言，HTML5胜出。尽管二者同样面临着严重的碎片化问题，不过HTML5先天具备的跨平台特性，可以在这方面占据先机。
用html5做的移动端网站好处如下：1. 上手迅速并支持快速迭代，与Android和iOS相比，使用JQuery Mobile和HTML5构建你的UI和逻辑会比在原生系统下构建快得多。此外，要使用原生代码将一个list view连接到远程的数据源并具有漂亮的外观是十分复杂的
2.避免麻烦的应用商店审批过程以及调试、构建带来的痛苦：为手机开发应用，尤其是iOS系统的手机，最痛苦的过程莫过于通过Apple应用商店的审批。想要让一个原生应用程序发布给iOS用户，需要等待一个相当长的过程（需要好几天，甚至可能是好几周）。不仅在第一次发布程序时要经历磨难，以后的每一次升级也是如此。这使得QA和发布流程变得复杂，还会增加额外的时间。进一步的好处是，发布beta或测试版本会更加容易。只要告诉用户用浏览器打开你的网址就可以了！不需要考虑iOS令人抓狂的DRM，也不需要理会Android必须的APK。
3.支持跨平台和跨设备开发：一个巨大的好处是，应用程序马上可以在Android和IOS上工作，同样也可以在其他平台上工作。作为一个独立开发者，为不同的平台维护基础代码是一项巨大的工作。为单个手机平台编写高质量的手机应用需要全职工作，为每个平台重复做类似的事情需要大量的资源。
