怎么把表达值与ENSEMBL匹配用r语言

怎么把表达值与ENSEMBL匹配用r语言

R语言中文本处理的重要一环,而R里面最强大的文本处理公式就是grep()一类的general函数(无需添加任何新的package)。下面以人类基因为例:library('biomaRt')mart &lt- us
Python350
《自然》评选改变科学的10个计算机代码项目

《自然》评选改变科学的10个计算机代码项目

从Fortran到arXiv.org,这些计算机编码和平台让生物学、气候科学和物理学等学科的发展达到了真正“日新月异”的速度。 2019年,事件视界望远镜团队让世界首次看到了黑洞的样子。不过,研究人员公布的这张发光环形物体的图像
Python180
第一次做生物信息学,求助

第一次做生物信息学,求助

你这个问题好大,生物信息学包含的内容太多,主要看你需要做哪些分析,是想学习分析,还是只是需要发表论文,如果学习,那是一个系统的学习,推荐学习两门语言,R语言和PERL语言,学习两个数据库,GEO和TCGA,这两个数据库是现在的主流,需要掌握
Python180
有关蛋白质的论文

有关蛋白质的论文

蛋白质(protein)是生命的物质基础,没有蛋白质就没有生命。因此,它是与生命及与各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质。机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质参与。蛋白质占人体重量的16.3%,即一个60kg重的成年人其体内约有
Python110
分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更
Python210
分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更
Python310
网络药理学如何写论文

网络药理学如何写论文

网络药理学写论文的材料素材:1、从要研究的方剂中药中获得有效成分。2、根据有效成分预测靶基因。3、根据表型获得对应的靶基因。4、有效成分对应的靶基因与表型对应的靶基因取交集。5、构建中药方剂有效成分靶基因网络。写作技巧基于系
Python210
基因或蛋白表达谱的时间动力学聚类分析(R包Mfuzz)

基因或蛋白表达谱的时间动力学聚类分析(R包Mfuzz)

在研究基因表达谱或者蛋白表达谱时,经常会涉及到对时间序列的分析。例如,不同的基因或蛋白表达水平随时间表现出怎样的动力学特征,怎样挖掘潜在的时间特征?本篇让我们来看一个能够分析基因表达谱或者蛋白表达谱的时间动力学特征的R包,Mfuz
Python220
网络药理学拓扑分析的条件

网络药理学拓扑分析的条件

网络药理学拓扑分析的条件1. 生物学网络拓扑分析需要一系列计算机程序和软件。2. 需要一组完整的网络数据,包括节点(蛋白质,基因等)和边(相互作用,调控等)。3. 需要有关药物作用机制的相关信息,如药物与蛋白质或基因的相互作用。4. 需要有
Python240
宇宙有尽头吗?

宇宙有尽头吗?

宇宙没有尽头。宇宙存在了136亿年,从大爆炸开始宇宙就在迅速的膨胀发展,在宇宙中形成星系星体,构造成我们现在的宇宙,并且现在的宇宙还正在膨胀,科学家就提出宇宙可能是不存在边缘的。因为现在我们所认知的宇宙一直存在于膨胀状态,所以对于宇宙边缘的
Python280
怎么用r语言进行dna序列分析

怎么用r语言进行dna序列分析

有现成的包:matchprobes包 里面有个函数basecontent(seq)计算4中碱基每种的含量;自己做的话:#List是你的序列 unlist(strsplit(List,""))-&gtsep.let
Python190
基因或蛋白表达谱的时间动力学聚类分析(R包Mfuzz)

基因或蛋白表达谱的时间动力学聚类分析(R包Mfuzz)

在研究基因表达谱或者蛋白表达谱时,经常会涉及到对时间序列的分析。例如,不同的基因或蛋白表达水平随时间表现出怎样的动力学特征,怎样挖掘潜在的时间特征?本篇让我们来看一个能够分析基因表达谱或者蛋白表达谱的时间动力学特征的R包,Mfuz
Python120
蛋白质组组学研究的基本策略是什么?

蛋白质组组学研究的基本策略是什么?

蛋白质组蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(genOME),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(PROTein). 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而
Python270
网络药理学中ko和hsa的区别

网络药理学中ko和hsa的区别

两者区别如下:KO的意思:是knockout的简写。相信大家也知道,在拳击比赛中,假如一名拳手把另一名拳手打低,后者倒下,躺在擂台上,在一段指定时间内都无力起身继续比赛的话,则拳证会判后者被“击倒”,这就是knockout或KO了。HSA是
Python890
分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更
Python180
有哪些专业就业前景不错?

有哪些专业就业前景不错?

就业前景如果单看就业率,肯定是工科类专业比较强的,毕竟这类专业毕业后成为工程师,在国家的发展过程中,是必不可少的一环,需求量大、离职率高,人才缺口一直比较大。如果要结合来看就业前景的话,那么还要考虑更长远的职业发展,而非眼前的工资收入。比如
Python180
分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更
Python130
绿萤光蛋白的发光原理是什么?

绿萤光蛋白的发光原理是什么?

我们知道,荧光的发光是被一定波长光激发后,电子被激发到高能级,随后向低能级跃迁的过程中发出比激发光波长更长的荧光,这也就是上面提到的受激辐射。我们将能接受光辐射,并跃迁发出颜色光的基团叫做生色团。绿色荧光蛋白含有一个三肽的单位Ser(65)
Python170
分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

分子生物学 蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更
Python180