R语言相关性分析

R语言相关性分析

1.  R语言自带函数cor(data, method=" ")可以快速计算出相关系数 ,数据类型:data.frame  如data.frame为:zz, 绘图如下:a. single protein:线性
Python100
确定聚类分析中的类别个数的方法

确定聚类分析中的类别个数的方法

以k-means聚类为例,对于一个聚类个数k,首先利用k-means聚类将样本聚成k类,然后计算k类中各类内各点与类中心的距离加和W(ki),进而计算k类的距离加和W(k)=sum(W(k1),…,W(ki),…,W(kk));根据原始数据
Python130
canberra用英语怎么说

canberra用英语怎么说

canberra有两个读法,分别是:英[ˈkænb(ə)rə]    美[ˌkænˈbɛrə] 。canberra,英语单词,主要用作名词,作名词时译为“堪培拉(澳大利亚的首都)”。堪培拉(英语:Canberra),是澳大利亚联邦的首都
Python160
R语言计算β多样性指数及分析

R语言计算β多样性指数及分析

计算β多样性指数需要用到phyloseq包。它的安装方式不同于简单的install.packages(“phyloseq”) 有两种方法可以安装 1.先安装BiocManager install.packages("B
Python140
聚类算法之K均值算法(k-means)的Python实现

聚类算法之K均值算法(k-means)的Python实现

K-means算法是硬聚类算法,是典型的基于原型的目标函数聚类方法的代表,它是数据点到原型的某种距离作为优化的目标函数,利用函数求极值的方法得到迭代运算的调整规则。K-means算法以欧式距离作为相似度测度,它是求对应某一初始聚类中心向量V
Python120
基于R语言的分类、聚类研究

基于R语言的分类、聚类研究

1.所有在对iris数据集分(聚)类研究中,setosa均可以完全正确分(聚)类,而另外两类则会出现不同程度的误差,这也是导致整个研究模型出现误差的原因; 2.在使用的三种分类研究方法中,决策树模型的效果最优,因此可以使用该方法进行鸢尾
Python140
debian sparkr怎么配置环境变量

debian sparkr怎么配置环境变量

1. SparkR的安装配置1.1. R与Rstudio的安装1.1.1. R的安装我们的工作环境都是在Ubuntu下操作的,所以只介绍Ubuntu下安装R的方法:1)在etcaptsources.list添加源deb h
Python140
r语言bpinom函数怎么使用

r语言bpinom函数怎么使用

r语言中bpinom函数的基本用法为:pbinom(x,size,,prob),该函数为事件的累积概率,它用于表示概率的单个值。例如:抛掷硬币100次,正面向上不超过50次的概率,即pbinom(50,100,0.5)。r语言有四个内置函数
Python130
WGCNA代码

WGCNA代码

WGCNA rm(list = ls()) #加载R包 library(WGCNA) library(tidyr) library(ggplot2) library(gridExtra) setwd("
Python100
r语言中可以做比分检验和wald检验吗

r语言中可以做比分检验和wald检验吗

1. Sigma:方差-协方差矩阵2. b:VAR-CoV的矩阵Sigma系数的矢量。3. Terms:一个可选的整数向量确定的系数应联合检验,使用一个瓦尔德chi-squared或F测试。4. L:可选的矩阵。5. H0:零假设6. df
Python140
求一部美国动漫!美国的

求一部美国动漫!美国的

RWBY《RWBY》是一部在2013年7月播出的动画。R、W、B、Y 分别是英语红白黑黄的首字母,代表的分别是四位女主角的主题色。由美国Rooster Teeth动画工作室RWBY团队制作,导演Monty Oum。已正式播放正片。分集剧情
Python130
python怎么做聚类树状图

python怎么做聚类树状图

 #-*- coding:utf-8 -*-import mathimport pylab as pl#数据集:每三个是一组分别是西瓜的编号,密度,含糖量data = """1,0.697,0.46,2,0.7
Python190
R语言哪些包可用来做聚类分析

R语言哪些包可用来做聚类分析

聚类的包,cluster包,里面包含了pam,agnes等函数,可以十分方便进行聚类计算。另外有系统自带的stats包,hclust,kmeans等函数。fpc包做聚类分析,也是可以的。另外,如果需要例子,这些包自带的文档里面都有使用的实例
Python250
R语言可以做参数估计么

R语言可以做参数估计么

中f指定所要求解方程的函数:interval是一个数值向量,指定要求解的根的区间范围:或者用lower和upper分别指定区间的两个端点tol表示所需的精度(收敛容忍度):maxiter为最人迭代次数。如果遇到多元方程的求解,就需要利用ro
Python210
python数据分析-聚类分析(转载)

python数据分析-聚类分析(转载)

聚类分析是一类将数据所对应的研究对象进行分类的统计方法。这一类方法的共同特点是,事先不知道类别的个数与结构;进行分析的数据是表明对象之间的相似性或相异性的数据,将这些数据看成对对象“距离”远近的一种度量,将距离近的对象归入一类,不同类对象之
Python200
R语言进行PCoA分析

R语言进行PCoA分析

#PCoA 分析在R语言中进行主要依赖于以下得包,进行这个分析得主要可以应用于形态学数据得相似与差异性分析。library(ade4)library(ggplot2)library(RColorBrewer)library(vegan)这里
Python150