linux服务器安装R语言及Rstudio server

2023-04-29 08:31:02Python020

linux服务器安装R语言及Rstudio server,第1张

在linux服务器上使用R语言及Rstudio server cat /etc/redhat-release: 查看服务器系统版本 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/src/base/R-3/R-3.6.1.tar.gzchecking for rl_callback_read_char in -lreadline... no configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages 6.安装 make make install 安装成功！ R #在命令行直接输入“R”即可进入R 编辑。 q() ##退出R编辑 7.安装R-studio-server wget https://download2.rstudio.org/server/centos6/x86_64/rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpmyum install rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm 8.R-studio-server的一些命令 rstudio-server start ##启动 rstudio rstudio-server stop ## 关闭rstudio rstudio-server status ## 查看rstudio 运行状态运行rstudio-server status出现 “Active: active (running) ” 表示rstudio 已启动 rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安装错误 rstudio-server restart ##重启 ifconfig ##查看服务器ip地址。查看运行中R进程 rstudio-server active-sessions 指定PID，停止运行中的R进程 rstudio-server suspend-session <pid> 停止所有运行中的R进程 rstudio-server suspend-all 强制停止运行中的R进程，优先级最高，立刻执行 rstudio-server force-suspend-session <pid> rstudio-server force-suspend-all RStudio Server临时下线，不允许web访问，并给用户友好提示 rstudio-server offline RStudio Server临时上线 rstudio-server online 8.rstudio-server系统设置主要有两个配置文件，默认文件不存在（非必要，可不做修改） /etc/rstudio/rserver.conf /etc/rstudio/rsession.conf vi /etc/rstudio/rserver.conf www-port=8080#监听端口,默认是8787，可以不做修改 www-address=127.0.0.0#允许访问的IP地址，默认0.0.0.0 rstudio-server restart vi /etc/rstudio/rsession.conf session-timeout-minutes=30#会话超时时间 r-cran-repos= http://ftp.ctex.org/mirrors/CRAN #CRAN资源库 rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安装，更改R所在目录。 9.通过浏览器连接Rstudio-server 直接打开浏览器，输入http://<服务器ip>:8787 ## 如果修改过rserver.conf文件，后面的8787端口改为相应的端口即可。这里需要我们输入用户名和密码。关于用户名有2点注意事项：（1）.不允许使用system 用户登陆，即用户ids小于100的用户。只能用普通用户登录（2）.用户的认证可以使用RSA。如果没有普通用户，可以添加： useradd newname # 添加一个名为newname的用户 passwd newname###给新用户newname 设置密码，密码需是复杂密码，否则可能通不过。 usermod -G happy newname ####将新用户newname添加到happy 用户组中，在用useradd添加用户之后，在默认的情况下，该账号是暂时被封锁的，也就是说，该账号是无法登录，须要用passwd命令来给新创建的用户设置密码之后才可以使用。 10可能存在的问题 10.1如果你的rstudio-server没有启动很大程度是安装有误，这里我将我遇到的错误分享出来 rstudio-server verify-installation There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did notconfigure with --enable-R-shlib. 这里就提到无法找到libR.so文件，原因是配置R语言文件时，没有加参数--enable-R-shlib. 这就必须要重新安装R语言。使用make uninstall 删除之前的安装，最好也删除R-3.6.1所在的文件夹，用“rm -r -f R-3.6.1". 使用rm 命令 -r 参数表示全部删除， -f 参数表示强制删除，不会提醒。同时使用这两个参数要小心。 10.2 普通用户无法启动rstudio-server sudo rstudio-server start## 以管理员方式执行命令这时会需要输入密码并提示 xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported. 如果不想出现上面的提示，就是给该用户提高权限，添加用户使用sudo的权利。 su root ###切换到root用户，如果有root权限的话。 chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的写权限 vi /etc/sudoers ###编辑sudoers文件，添加权限。找到这行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (这里的xxx是你的用户名) youuserALL=(ALL)ALL %youuser ALL=(ALL)ALL youuserALL=(ALL)NOPASSWD: ALL %youuser ALL=(ALL)NOPASSWD: ALL chmod u-w /etc/sudoers ##撤销sudoers文件写权限

一.准备安装所需要的软件：

1.VMware虚拟机的下载和安装在我的博客中已经提到，这里就不再详细阐述。

2.下载一个redhat，因为redhat已经商业化了，推荐大家使用centos，如果自己有合适的linux安装版本，可以不使用这个。

二.在VMware虚拟机为RedHat Linux创建新的虚拟机：

1.打开虚拟机，选择新建虚拟机：

2.选择自定义（这里选择典型可能会在安装过程中出现一个硬件找不到的错误，所以推荐选择自定义），然后点下一步：

3 作系统选择linux，版本不用修改：

4.命名，并选择虚拟操作系统的存放位置（位置所在硬盘空间最好大于5G）：

5.给虚拟机分配内存（这个自己看情况，我的电脑内存是512，给虚拟机分配了256）

6.选择虚拟机网络类型（推荐使用桥接网络）

7.选择磁盘类型，这里选择IDE（这也是第三步选择自定义的原因，因为选择典型的话，系统会自动选择SCSI硬盘，而有的linux，主要是早的linux版本，不能使用SCSI硬盘，所以才会出现没有发现硬盘的错误）

8.指定磁盘容量（推荐大小为8g，基本够用了）