第一次做生物信息学,求助

Python014

第一次做生物信息学,求助,第1张

你这个问题好大,生物信息学包含的内容太多,主要看你需要做哪些分析,是想学习分析,还是只是需要发表论文,如果学习,那是一个系统的学习,推荐学习两门语言,R语言和PERL语言,学习两个数据库,GEO和TCGA,这两个数据库是现在的主流,需要掌握的。学习资源可以取生信自学wang和丁香园,都可以学到不少东西。如果是写论文,可以直接找生信分析的人,把分析好的数据和图片给你,你就可以写论文了,当然找人家做一般都是有偿的。

学习语言:R perl程序 两大数据库

GEO芯片数据库

TCGA癌症数据库,包括癌症的临床信息,表达信息,甲基化,SNP,数据量大,全面

生信菜鸟团上大学之后,我上网找资料时发现的第一个博客就是生信菜鸟团,里面包罗万象,涵盖很多方面(初次发现时,就感觉自己进入了新的天地)rabbit gao's blog  我超喜欢这个师兄的博客里面的笔记,很直观,尤其是python那部分。他是以代码的形式展示内容。沈梦圆博客梦圆师姐,和我一样喜欢用熊猫头像,她的博客也是刚刚建立不长时间。师姐的文笔很赞,看里面博文相信对你有帮助的。生信日志|鸣一道鸣一道师兄的博客我比较喜欢的是R做图那一块plob这个我比较少看,不过内容也不错,我后续再写上这个博客的描述。陈连福博客 听说连福老师有开培训班,实力自然也不差。糗世界←欢迎来到糗糗的世界糗世界主要包括:序列比对与NGS  R/bioconductorcircos教程,其中糗世界关于R和bioconductor以及NGS的归纳总结特别详尽生信客部落生信客部落是我自己的博客,刚建不久(2016.9.3建的),我目前在准备考研,打理的时间不多。但相信是一只潜力股,有提升的空间。也欢迎博友们交换 "友情链接".hope博客  hope 他(她)有一篇关于生物信息学在线工具的总结,我特别喜欢科研动力“endnote使用宝典”,专注写endnote相关的内容。(注:endnote 是文献管理的软件,插入引用文献的神器)biochen生物伯臣生物里也蛮多归纳整理的Bob's Blog   bob这位兄弟的博客我接触不多,我后续补上描述.论坛(包括生信论坛和其他一些相关的网站):生信技能树生信技能树前面那个师兄有详细描述过。我也亲眼见证了它从无到有的过程,看着生信技能树感觉特别亲切,感觉就像自家的孩子一样。我自己由于准备考研和书写毕业论文的事情,在生信技能树建设的参与度不高。总之,好喜欢......生物信息学天空内容超全的一个生信论坛丁香园(生信板块)丁香园,就不解释了,一个国内最成功的论坛之一。医学生基本都知道的一个论坛。小木虫小木虫,里面蛮多资源的,也是国内最成功的论坛之一生物统计家园描述待输入...基因堂描述待输入biostars这是一个生信问答网站生信刷题网站ROSALIND | About 这个是一个生物信息的刷题网站,超多实战题(纯英文,既提高英语水平,又训练了自己的实战能力,何乐而不为)。实战走起......生物信息学在线工具网站生信客部落生物信息工具整合(包含在线工具与离线工具)–更新中这里面包含了一些生物信息学可视化工具,包含在线的工具和一些离线的可视化工具,由于目前个人水平有限,所以还有待继续完善

http://statdtedm.xilubbs.com/ 生物统计学论坛

http://www.statstar.com/ 一统天下论坛

http://unidata.51.net/cgi-bin/bbs3000/list.cgi 技术论坛(联数工作室姊妹网)

http://www.baidao.net/stat/cgi-bin/forum_show.cgi 百岛潮论坛

http://bbs.miforum.net/cgi-bin/forums.cgi?forum=19 医学信息学 统计学讨论

http://www.boso.com.tw/cgi-bin/board.exe/viewboard?acc=2013 统计生活馆统计论坛

http://www.bioon.net/list.asp?boardid=25 生物医学软件与统计学(中国生命科学论坛)

http://www.dxy.cn/bbs/post/page?bid=71&sty=1&age=0 数理统计与图表制作(丁香园)

http://www.spssclub.com SPSS俱乐部

http://club.excelhome.net/ 中文Excel应用论坛

http://202.112.84.101/~ouyang/stat.htm Statistics 教&学new!

http://www.xybms.com/index.htm 湘雅生物医药统计中心new!

二、国外统计杂志、软件及相关网址

1. 杂志

http://www.stata.com/links/journals1.html 统计杂志1

http://www.maths.lancs.ac.uk/dept/stats/journals/ 统计杂志2

http://www.stata.com/links/journals2.html 生物科学中的统计杂志

http://www.interscience.wiley.com Statistics in Medicine

http://stat.tamu.edu Biometrics

http://www.elsevier.nl/inca/publications/store/5/0/5/9/6/0/

Computer methods and programs in Biomedicine

http://www.amstat.org/publications/jcgs/index.html

美国计算与绘图杂志(Journal of Computational and ...

http://www.hotwired.com 网上杂志

http://www.nature.com/ 自然

http://www.sciencemag.org/ 科学

http://www3.mdanderson.org/library/online_journals/ajrnls.html 在线杂志大全new!

2. 软件

http://www.stata.com/links/stat_software.html 统计软件

http://www.download.com 软件下载站点

http://www.oswego.edu/%7Eeconomic/econsoftware.htm 计量经济学软件

http://www.sas.com SAS

http://www.jmp.com JMP(SAS公司推出的极富有市场潜力的点菜单交互式软件)new!http://www.spss.com SPSS

http://www.mathsoft.com/splus S-Plus

http://www.stata.com Stata

http://www.statsoft.com Statistica(内含非常实用的电子统计学教材)

http://www.systat.com SYSTAT

http://multilevel.ioe.ac.uk/index.html MLwin (多水平模型)

http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs WinBUGS1.4(免费软件,贝叶斯方法)

http://www.cdc.gov/epiinfo Epi Info 2002(免费软件,流行病学软件)

http://www.r-project.org R语言(免费软件,类似S语言、Splus)

http://www.epidata.dk/download.php EpiData3.0 (多语种免费软件,简单数据输入与转化,仅1.2M)new!

http://www.datamost.com StatMost

http://www.simstat.com SimStat

http://shazam.econ.ubc.ca SHAZAM

http://www.datadesk.com/datadesk DataDesk

3.卫生统计学

http://www3.who.int/whosis/menu.cfm WHO卫生统计信息系统(WHOSIS)

http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/healthstatistics.html 卫生统计部分的Medline

http://www.lib.umich.edu/hw/public.health/health.stats.html#IHS 国际卫生统计

http://www.bls.gov/bls/other.htm 其他卫生统计网址

4. 其他相关网址

http://www.math.yorku.ca/SCS/StatResource.html 统计学与统计绘图资源 new!http://www.lexjansen.com/index.htm Lex Jansen个人主页(SAS SUGI pdf论文) new!

http://home.okstate.edu/homepages.nsf/toc/onlinetutorialsstatistics 统计学指南

http://www2.chass.ncsu.edu/garson/pa765/statnote.htm G. David Garson的在线教材

http://www.astro.psu.edu/statcodes/sc_multvar.html 多变量分析与分类

http://www.rdg.ac.uk/~sns99kla/links.html 统计遗传学网址

http://ubmail.ubalt.edu/~harsham/stat-data/opre330.htm 统计学数据分析问题

http://www.stat.ufl.edu/vlib/jobs.html 美国统计找工作(job chance)

参考资料:http://www.ipgy.net/Print.asp?ThreadID=7431