如何在linux环境下使用r语言

Python022

如何在linux环境下使用r语言,第1张

1、下载

wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz

2、解压:

tar -zxvf

R-3.0.1.tar.gz

cd R-3.0.1

3、安装 (当然也可以跳过)

yum

install readline-devel

yum install libXt-devel

./configure

4、 配置环境并编译安装

#

如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib

(这个我不需要,所以加入到后面)

# 如果3没安装, 那么后面加上: --with-readline=no

--with-x=no

./configure --prefix=/usr/R-3.0.1

make $$ make install

5、配置环境变量并生效

vi

.bash_profile

export R_HOME=/usr/R-3.0.1

export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

# 试环境变量生效

source .bash_profile

6、 命令行测试

[admin@JD

software]$ R

WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"

Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing

Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由软件,不带任何担保。

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用'q()'退出R.

>q()

7、创建脚本测试(t.R)

cd

/opt/script/R

vim t.R

#!/path/to/Rscript

#第一行

x<-c(1,2,3)

#R语言代码

y<-c(102,299,301)

model<-lm(y~x)

summary(model)

8、测试:执行脚本

R CMD BATCH

--args /opt/script/R/t.R

more

/opt/script/R/t.Rout

#查看执行的结果

或者第二种方式

Rscript

/opt/script/R/test.R

#结果直接输出到终端

你是不是用R Gui安装的,提示已经说了缺少quadprog依赖包,

用R Gui安装的话需要先把依赖包一个个安装上,比较麻烦,

可以在Rstudio上安装,

install.packages('tseries')

also installing the dependencies ‘quadprog’, ‘zoo’

trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.3/quadprog_1.5-5.zip'

Content type 'application/zip' length 52439 bytes (51 KB)

downloaded 51 KB

trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.3/zoo_1.7-13.zip'

Content type 'application/zip' length 899932 bytes (878 KB)

downloaded 878 KB

trying URL 'https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.3/tseries_0.10-35.zip'

Content type 'application/zip' length 327381 bytes (319 KB)

downloaded 319 KB

package ‘quadprog’ successfully unpacked and MD5 sums checked

package ‘zoo’ successfully unpacked and MD5 sums checked

package ‘tseries’ successfully unpacked and MD5 sums checked

The downloaded binary packages are in

C:\Users\yuexf\AppData\Local\Temp\RtmpqqGpKz\downloaded_packages

>library(tseries)

‘tseries’ version: 0.10-35

‘tseries’ is a package for time series analysis and computational finance.

See ‘library(help="tseries")’ for details.

它会自动把依赖包给你安装上

R是不断更新的一个工具,里面的扩展包的使用是和R的版本还有byte相关的,所以这里根据你的报错信息来看, 你要检查一下你的R版本,保证在3.2以上能够使用这个扩展包.

R里的复杂扩展包一般都是有依赖包存在的,一般使用install.packages命令会让R也同时自动下载依赖包,这里你没有提供依赖包下载信息,默认应该都被自动下载好了.

另外一种情况就是R并不下载依赖包,但是在使用library()命令时也会加载一些其他包来使目标包可以被加载成功,这时会有warning信息.