r语言里面怎么安装pheatmap

Python031

r语言里面怎么安装pheatmap,第1张

一般在R语言中安装需要的包，将计算机处于联网环境下使用install.packages("pheatmap")指令进行在线下载安装。或者将相关源码从CRAN下载后在本地环境下编译后安装。

在EXCEL中整理好样本和物种的注释信息，当然这个需要依据你的具体需求来确定。

在RStudio 中使用 read.table 函数来导入行或列的分组注释信息

注意： data.1是pheatmap包基础篇中介绍过使用z-score中心化和标准化的数据；

具体可以参考上一期内容

这是注释颜色，好像不是特别好看，根据自己美感慢慢调节

运用R语言 pheatmap 包绘制热图进阶部分的内容就到这结束了。

R语言绘图包系列：

热图输入的数据是数值型矩阵/数据框，颜色的变化展示数值的大小。

1.保存对象

2. 打开图形设备重新画

pheatmap包使用的是grid图形系统而非ggplot2，所以解决方法也是不同的。通过自定义函数来生成，也可一次绘制多个对象的图形。