R语言之ggplot

Python013

R语言之ggplot,第1张

ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离。按图层作图,保有命令式作图的调整函数,使其更具灵活性,并将常见的统计变换融入到了绘图中。

ggplot的绘图有以下几个特点:第一,有明确的起始(以ggplot函数开始)与终止(一句语句一幅图);其二,图层之间的叠加是靠“+”号实现的,越后面其图层越高。

ggplot2里的所有函数可以分为以下几类:

一个图形对象就是一个包含数据,映射,图层,标度,坐标和分面的列表,外加组件options

ggplot(数据, 映射) geom_xxx(映射, 数据) stat_xxx(映射, 数据)

点(point, text):往往只有x、y指定位置,有shape但没有fill

线(line,vline,abline,hline,stat_function等):一般是基于函数来处理位置

射(segment):特征是指定位置有xend和yend,表示射线方向

面(tile, rect):这类一般有xmax,xmin,ymax,ymin指定位置

棒(boxplot,bin,bar,histogram):往往是二维或一维变量,具有width属性

带(ribbon,smooth):透明是特征是透明的fill

补:包括rug图,误差棒(errorbar,errorbarh)

然后,就是按照你的需要一步步加图层了(使用“+”)。

本系列课程要求大家有一定的R语言基础,对于完全零基础的同学,建议去听一下师兄的《生信必备技巧之——R语言基础教程》。本课程将从最基本的绘图开始讲解,深入浅出的带大家理解和运用强大而灵活的ggplot2包。内容包括如何利用ggplot2绘制散点图、线图、柱状图、添加注解、修改坐标轴和图例等。

本次课程所用的配套书籍是: 《R Graphic Cookbooks》

除了以上的基本图形外,师兄还会给大家讲解箱线图、提琴图、热图、火山图、气泡图、桑基图、PCA图等各种常用的生信图形的绘制,还不赶紧加入收藏夹,跟着师兄慢慢学起来吧!

柱状图可能是最常用的一种数据可视化。它们通常用于显示数值(在y轴上),用于显示不同类别的数值(在x轴上)。例如,柱状图可以用来显示四种不同商品的价格。柱状图通常不适合显示一段时间内的价格,因为时间是一个连续的变量。

在制作柱状图时,您应该注意一个重要的区别:柱状图的高度有时表示数据集中的案例数,有时表示数据集中的值。记住这一区别——这可能会引起混淆,因为它们与数据的关系非常不同,但两者使用相同的术语。

拓展: position参数: 此处的position主要是指对图像的微调,最常见的应用是在分组的柱形图(bar)中,因为分组的柱形图会产生组内堆积和不堆积两种主要效果。