![[R语言] GO富集分析可视化 GOplot::GOCircle,第1张](/aiimages/%5BR%E8%AF%AD%E8%A8%80%5D+GO%E5%AF%8C%E9%9B%86%E5%88%86%E6%9E%90%E5%8F%AF%E8%A7%86%E5%8C%96+GOplot%3A%3AGOCircle.png "[R语言] GO富集分析可视化 GOplot::GOCircle,第1张")
查看GOplot内示例数据的格式，对自己的数据做处理
观察结论：
观察自己的两个数据表：
table.legend 设置为T时会显示表格
本图中表格和图例是出图后剪切拼合而成，没有用R中的拼图包
PCR数据要有三列，一列是组名，一列是内参基因的CT值，一列是目的基因的CT值，计算方法是-2 ∆∆Ct 法，实现一步出图用的是 ggpubr ，实现截断则是Y叔出手的 ggbreak
以前很少有包可以完美实现这个功能，我以前写过 R做截断柱状图并加显著性统计 可以实现，但Y叔出手写了个 ggbreak 包，完美的就解决了
其实还有一个 pcr 的包也能简单实现，而且自动计算mRNA相对表达定量，而且对照组定量是1，更加科学，但是表格只是两列CT值，还要重新定义组，所以要先提取一下表格，处理一下数据。
也可以截断，还是 ggbreak
原始数据存储在一个excel文件里，这个excel文件里有三个子表格，每一个子表格的数据如下：
总的数据格式
现在的需要是做如下的图
比如这里我新建了一个子表格sheet4,数据最终的格式如下
这里用到的是标准误
这里新学到一个知识点是，柱子默认是不贴底的，如果要贴底使用函数 scale_y_continuous(expand = expansion(mult = c(0,0.1)))
mult对应的两个值一个是控制下面，一个是控制上面，贴底就设置为0 就可以了
小明的数据分析笔记本
