使用到的是R语言的 poppr 包中的 read.genalex() 函数
poppr 第一次使用需要先安装
读入数据
读入数据直接是 genclone object,使用函数 genclone2genind() 将其转换成genind object,接下来使用 ade4 包中的 dudi.pca() 函数做主成分分析
主成分的结果存储在li中
还是认为的分个组,然后做散点图
明天的推文再继续这部分内容吧!
(供自己记录)adj位置调整
ask询问
bg背景
bty图形边框风格,o四边都有边框,l左边和下边,7右边和上边,c上边、左边和下边,
cex设置点和字符的大小,axis坐标轴上标签字的大小,lab坐标轴上命名的大小,main标题的大小,sub副标题的大小,col颜色。
family字体的风格,
fg前景颜色
font图片字体的风格,字体,粗体,斜体
las坐标轴的运行关系,坐标轴上的字和坐标轴的关系,字会转
lend线的两端的样式
lty线的形式,直线、虚线
lwd线的粗细
Mai、mar、mex画布的大小
Mfcol、mfrow是来切分画布的,放几个fig在画布中,两个功能一样
pch是用来定义点的形状的,有25个形状
srt用来定义图中的文字的角度
Txk坐标轴上的刻度的大小,刻度的字体大小
Xaxt/yaxt不想要坐标轴的标签
Xlog/ylog是x轴和y轴设置为log值
Xpd把绘图区设置为整个画布
Fig表示图形的四个角的位置
New是在图中生成图