注意区分： 数据类型 和 数据组成类型（数据结构）
数据类型 ：整型、浮点型、字符型、布尔型（不同的语言不同的叫法）
数据结构 ：向量(c())、矩阵(matrix())、数组(array())、列表(list())
注意：这里把 数据框 单拿出来讲（因为它比较特殊）
接下来通过一个实例讲解一下 S4数据结构 。这是我采用clusterProfiler做KEGG富集分析时的一个结果，其采用 S4数据结构 形式存放：
R语言中矩阵、向量在内存上的区别
向量
在初始创建时，系统就给分配了足够的空间，没有赋值的下标对应的值都用NA代替了，所以向量不存在下标超出的限制比如：
>x
[1] 1 2
>length(x)
[1] 2
>x[100]
[1] NA
>length(x)
[1] 2
>x[100]=3
>length(x)
[1] 100
创建x时给了两个数字，所以长度为2。但是取值x[100]时显示的是NA并非下标越界，当赋值x[100]=3时，x的长度变为了100。
这种性质的好处就是可以取代向量的重新赋值语句比如：
>x<- c(x,2)
可以使用以下语句代替：
>x[length(x)+1]=2
这样的好处就是由于不用重新赋值，不需要重新分配内存，因此可以大大提升程序的效率，比如：
>create_vector2<-function(k)
+ {
+ gh=c()
+ for(i in 1:k){
+ gh=c(gh,i)
+ }
+ return(gh)
+ }
>create_vector1<-function(k)
+ {
+ gh=c()
+ gh[1:k]=1:k
+ return(gh)
+ }
以上为两个创建向量的函数，运行时间测量如下：
>system.time(create_vector1(10000)) #创建10000长度的向量，函数1运行时间
用户 系统 流逝
000
>system.time(create_vector2(10000)) #创建10000长度的向量，函数2运行时间
用户 系统 流逝
0.11 0.00 0.11
>system.time(create_vector1(100000)) #创建100000长度的向量，函数1运行时间
用户 系统 流逝
000
>system.time(create_vector2(100000)) #创建100000长度的向量，函数1运行时间
用户 系统 流逝
11.48 0.01 11.71
可以看到函数1明显比函数2快很多。函数1的运行时间基本为0。
矩阵
矩阵并没有这种性质，矩阵的内存空间是初始创建空间的大小。一但确定，只有通过重新赋值来改变。所以会出现下标越界等错误。
R语言数据结构主要有以下四种：
四种数据结构，重点掌握 向量 和 数据框
判断数据结构的函数： class()
向量的详细讲解在上一篇文章，以下主要讲数据框，矩阵，列表：
以下大部分操作使用的数据框为df
几个重要的函数：查看数据框的行数和列数，行名和列名；以及单独查行的数量，列的数量
数据框取子集有几种方法 ： $ 符号，坐标，名字，逻辑值
在 [,] 里，行在前面（左边），列在后面（右边），行与列用逗号 , 隔开： [行,列]
中括号里的逗号，表示维度的分割
数据框按照逻辑值取子集，TRUE对应的行/列留下，FALSE对应的行/列去掉。
修改第二列的列名，就是修改列名这个向量的第二个元素
https://blog.csdn.net/weixin_39718006/article/details/110516670
后续的笔记会有详细介绍
矩阵不能用 $ 符号取子集
t()：转置函数，行与列的互换
as.data.frame()：转换，把矩阵变为数据框 ，用as.matrix()函数也能把数据框变为矩阵
聚类，相似的行，相似的列会聚在一起。热图自动聚类，行和列的相对位置发生了变化，只是列与列，行与行之间的变化规律。
![热图自动聚类]]( https://upload-images.jianshu.io/upload_images/17511166-f6e2432a04cffbbe.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240 )
热图默认聚类，修改参数，不让聚类，热图与表达矩阵对应。
默认的设置不符合自己的预期，可以子啊作者允许的范围内定义。
查看函数帮助文档，参考修改，达到自己的要求。
列表没有列名和行名，只有元素的名字。列表可以由数据框，矩阵，向量，单独的一个数字都可以组成。
列表没有行和列的概念，只有元素，取子集的两种方式： [[]] ， $ ，
$ 有两个作用：数据框取子集和列表取子集。在矩阵和向量里不能用 $ 。
用 class() 函数更能具体说明问题， 判断数据结构和数据类型
以上内容是听 生信技能树 小洁老师的 R语言线上课 ，根据自己的理解记录下来，小洁老师授课非常细心，对不同水平的同学都照顾到，并且补充很多技巧以及注意事项。
认识R语言的四种数据结构，小洁老师强调重点掌握向量和数据框，在实战中遇到很多数据结构都是数据框，表达矩阵可以转化为数据框，数据框的一列可以看做是一个向量。小洁老师把实战中会需要的操作融入到练习题，在实战中能联想起小洁老师讲过的知识点。
