R语言——列表

Python022

R语言——列表,第1张

前一段工作太忙了,终于又有时间来继续学习了

列表就是一些对象(或成分,component)的有序集合。列表允许整合若干(可能无关)对象到单个对象名下。也就是说,某个列表中,可能是托干个向量、矩阵、数据框,甚至是其他列表的组合。函数list()可创建列表。

下面创建一个列表

上述例子创建了一个列表,其中有四个成分:一个字符串、一个数值型向量、一个矩阵以及一个字符型向量。可以任意组合任意多的对象,并将它们保存为一个列表。

注意:可以通过双重括号知名代表某个成分的数字或者名称来访问列表中的元素。

列表允许以一种简单的方式组织和重新调用不相干的信息。其次,许多R函数的运行结果都是以列表的形式返回的。

一些小tips:

1、对象名称中的句点   .    没有特殊意义,但$ 和其他语言中句点有相似的意义,即指定一个数据框或列表中的某些部分。例如,A$x是指数据框A中的变量x。

2、R不提供多行注释或者是块注释功能。

3、将一个值赋予某个向量、矩阵、数组或者列表中一个不存在的元素时,R将自动扩展这个数据结构以容纳新值。

4、R中没有标量。标量以单元素向量的形式出现。

5、R中的下标不从0开始,而是从1开始。

6、变量无法被生命。他们在首次被赋值时生成。

1. NaN

R中的无定义数用NaN表示,即“Not a Number(非数)”。

不过在R中,R实际上是把NaN视作一个数的,当其参与运算时,返回结果总是NaN。我们可以使用is.nan()函数来检测计算结果有无定义,但是需要注意的是,对于NaN而言,is.finite()和is.infinite()都会返回FALSE。

2. NA

NA表示缺失值,即“Missing value”,是“not available”的缩写

3. Inf

R中的无穷大用Inf表示(即Infinity,无穷大),负无穷表示为-Inf。

要检查一个数是否为无穷,可以使用is.finite()或者is.infinite()函数

3. NULL

R语言中,NA代表位置上的值为空,NULL代表连位置都没有,变量为空,其长度为0,表明“空无一物”

将两个数据进行除法运算

而log2_foldchange就是我们需要的数据,发现里面有许多 NaN、 -Inf 、Inf ,想办法进行数据清洗。

都到这一步了,再绘制两个图形玩玩:

数据准备

1 图内标注

函数text()用于绘图区域内部添加文本

函数:text(x, y = NULL, labels = seq_along(x$x), adj = NULL, pos = NULL, offset = 0.5, vfont = NULL, cex = 1, col = NULL, font = NULL, ...)

x和y:用于指定添加文本的位置坐标,为数值型向量。如果,x和y向量的长度不同,则短的将会被循环使用。

labels:指定添加文本的内容,为字符串向量。

adj:调整文字的位置。其值位于[0,1]之间。当adj为1个值时,是调整labels的x轴的位置,当是2个值时,第1个调整的是x轴的位置,第2个调整的是y轴的位置。

pos:调整文字的方向位置,如果给定了此值,将覆盖adj给定的值。1,2,3和4分别对应坐标的下,左,上和右。

offset:此参数需要与pos结合使用。当指定pos时,给出字符偏移量。

vfont:NULL值为默认使用当前字体族。或者是一个长度为2的矢量字体字符向量。向量的第一个元素用于指定一种字体,第二个元素用于指定一种样式。如文本标签用表达式给出,则该项设置将被忽略。

cex:设置字体大小,如果为NA或NULL,则设置为1。

col:设置文本的颜色。

font:设置文本字体,1是默认值,普通文字,2代表加粗,3代表斜体, 4代表加粗+斜体,5只有用来ADOBE的设备上时,才有用。

srt:文本倾斜的角度。

1.1 指定坐标添加文本

1.2 指定坐标添加多个文本

1.3 对图形元素添加文本标注

1.4 特殊符号

有时候需要在图上标注诸如求和、积分、上下标等数学符号,还有一些公式等。这里需要用到函数expression(...),...是要输入的表达式。 可以通过help(plotmath)以获得更多表达式的细节和示例。

2 图外标注

函数mtext()用于在图形四个边界之一添加文本。

mtext(text, side = 3, line = 0, outer = FALSE, at = NA, adj = NA, padj = NA, cex = NA, col = NA, font = NA, ...)

text:指定文本内容。

side:指定是哪个页边空白(1=下面,2=左边,3=上边,4=右边)。

line:指定文字出现的位置,文字和对应坐标轴平行。从坐标轴开始向外从0开始计数。

at:以用户坐标指定字符串位置。

adj:调整阅读方向。为使字符串平行坐标轴,adj=0,意味着左对齐或下对齐,而adj=1表示右对齐或上对齐。

padj:调整每个字符串垂直阅读的方向(它通过adj控制)。对于平行轴的字符串,padj=0表示右或上对齐,padj=1表示左或下对齐。

cex:调整字体大小,默认为1。

font:调整文字字体。

col:调整文字颜色。

参考资料:

《R语言实战》(中文版),人民邮电出版社,2013.

R语言中使用text()函数给绘图添加文字, https://www.biye5u.com/article/r/2018/6381.html

投必得R语言教程,第二讲 R作图-基础-图形参数设置:标题、图例、文字, https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU1Mzc3OTIwNg==&mid=2247495531&idx=1&sn=cdd80d4e950ae2b344cf188c68922fa8&chksm=fbef0602cc988f14e93b71bc6fcc2fda782d3ae9a3a67601a6c87756f4ae85bcc5d9c56d9b51&scene=21#wechat_redirect