小版本的更新，会公用一个目录，比如4.0.5和4.0.6是不需要变化目录的，library中的包应该是兼容的。然后就是各种更新了。
就是下载安装就行了，因为已经copy过了，所以3.6的包能在4.0上的，就不会重新安装，不能用的，就会自动安装。
——“哈喽，能请教你一下怎样在R server中调用Linux下的工具？”
——“你为什么要这么做呢？”
——“我想把Linux工具输出的结果直接在R中分析，不想换来换去”
bedtools 是一个非常香的工具，几乎是人尽皆知，是一个强大的处理bed等文件的工具，正如其自己描述的一样： a powerful toolset for genome arithmetic 。bedtools目前只支持在Linux下以命令行的形式运行，所以我们经常会遇到上面的问题。
那么如何解决呢？给大家分享一个好物，既然我们不想在Linux下运行bedtools，那为什么不在R下运行呢？感谢 北卡罗来纳大学教堂山分校的Phanstiel Lab 给了我们这样的机会，开发出了R下的bedtools—— bedtoolsr 。 不过，有喜必有悲，看下面这句话：
bedtoolsr should work on any system with R and bedtools installed. It has been tested on macOS (version 10.14 "Mojave") and Linux (Ubuntu version 18.04). bedtools is not available for Windowshowever, you can either use a virtual machine or Windows Subsystem for Linux . In either case, R from the Windows side would not be able to access bedtools running on the Linux side, so R and bedtoolsr would also have to be installed on the Linux side.
bedtools intersect的功能不用多介绍，直接上图：
这不是和bedtools intersect功能选项几乎一模一样？
这里还是用官网的示例数据来做，主要是想输出有交集的染色体坐标区间及相交区域的大小：
更多的功能就待大家去探索了~把这个包支持的函数全部列在下面了，对应bedtools的工具找就好了！
今天又是摸鱼的一天！
R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。
R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制图的优秀工具。
发展历史
R是统计领域广泛使用的诞生于1980年左右的S语言的一个分支。可以认为R是S语言的一种实现。而S语言是由AT&T贝尔实验室开发的一种用来进行数据探索、统计分析和作图的解释型语言。最初S语言的实现版本主要是S-PLUS。
S-PLUS是一个商业软件，它基于S语言，并由MathSoft公司的统计科学部进一步完善。后来新西兰奥克兰大学的Robert Gentleman和Ross Ihaka及其他志愿人员开发了一个R系统。
由“R开发核心团队”负责开发。R可以看作贝尔实验室（AT&T BellLaboratories）的Rick Becker、John Chambers和Allan Wilks开发的S语言的一种实现。
当然，S语言也是S-Plus的基础。所以，两者在程序语法上可以说是几乎一样的，可能只是在函数方面有细微差别，程序十分容易地就能移植到一程序中，而很多一的程序只要稍加修改也能运用于R。
