开始一个新的R语言数据分析新项目,管理脚本、图片、文件的推荐方式:打开Rstudio,新建Rproject,新建脚本(脚本存放在生成的Rproject文件夹中)。
若要逆着优先顺序操作,将返回NA
x %in%y是判断x中的每一个元素是否在y中存在。
若x和y长度不一致,返回x个TRUE或者FALSE。
⚠️练习:按如下方式生成test数据框,提取test中,最后一列值为a或c的行,组成一个新的数据框,赋值给test2。
这里如果使用==来判断,就相当于拿test$n的15个值与c('a','c')的2个值来一一对应着比对,因为两者长度不同,会发生循环补齐,其效果如下图,明显不是我们想要的结果。
x%in%y:选出x是y中一个值时的所有行
另:取交集、差集、并集的函数为:intersect(x,y)、union(x,y)、setdiff(x,y)、setdiff(y,x)
match函数的用法参考: https://blog.csdn.net/woodcorpse/article/details/84927296
使用match函数修改矩阵的信息
方法1--设置CRAN镜像:打开R studio,点击tools--global option--packages,选择Package CRAN reposotory。
方法2--设置CRAN和bioconductor镜像
用于读取/导出文件的R包
rio可以不用区分读入文件类型,大部分文件可直接用import()读取。
@ 是R中,S4类的一个操作符, 用于提取S4对象中的内容(slot) ,比如:
这个时候$是不起作用的,因为被S4类重写了。可以自己定义$的行为。
⚠️: matrix不能直接用$取列
⚠️因此如果想取数据框中的部分行,在方括号中直接输入行数即可,返回的仍然是数据框。但如果加了逗号,会丧失数据框的格式,也就是会使数据框的行名(往往是基因名)丢失。
后面存图时可以用paste0连接GSE编号和图片类型及后缀,这样不同数据的分析得到的图片名就跟数据相一致。
通过将变量因子化来设置柱条的顺序
R语言的Blogdown包可以非常方便的帮助我们构建自己的个人网页,作者Yihui Xie 专门给这个R包写了一本书
链接是 https://bookdown.org/yihui/blogdown/
自己最近在学习这个R包构建个人网页,在youtube上找到了一个非常好的视频教程,手把手教学,每一步都有详细的介绍。
链接是 https://www.youtube.com/watch?v=8xbxXR_Iu5Y&list=PLpZT7JPM8_GbPiX4ibrP7ogl7GyEofZMj
总共16个视频,每个视频在10到20分钟,可以先把视频整体看一遍,然后再按照视频中一步一步操作
以下是我按照视频教程做的自己的网页的截图
下面还可以放自己发表的论文。个人感觉如果申请硕士博士在自己的简历里放上一个个人主页链接,瞬间档次提升不少 哈哈哈,尤其是申请国外的硕博的话。
大家如果访问youtube不方便的话,我把视频教程扒下来放到了B站,大家可以到我的B站账号看。虽然教程是英文的,听不懂也没关系,按照视频中的操作一步一步来就行。不用听懂。
我的B站主页 https://space.bilibili.com/355787260/channel/series
小明的数据分析笔记本