【R语言】解决GO富集分析绘图,标签重叠问题前面我给大家详细介绍过☞GO简介及GO富集结果解读 ☞四种GO富集柱形图、气泡图解读 ☞GO富集分析四种风格展示结果—柱形图,气泡图 ☞KEGG富集分析—柱形图,气泡图,通路图 ☞DAVID G2023-03-05Python100
如何使用R语言的ggplot2包画气泡图ggplot2:不用说,画图神器reshape2:变形,整合stringr:处理字符串lubridate:处理时间RODBC:链接数据库plyr:拆分,合并,重组。knitr:谢益辉,自动化报告包ggmap:ggplot2+map的一个包,2023-03-05Python140
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R语言:clusterProfiler进行GO富集分析和Gene_ID转换ID转换用到的是 bitr() 函数,bitr()的使用方法: org.Hs.eg.db包含有多种gene_name的类型keytypes() :keytypes(x),查看注释包中可以使用的类型columns() :2023-03-05Python140
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R语言可视化之ggplot2——KEGG通路富集分析之前分享了如何用ggplot2可视化GO分析的结果。既然做了GO,当然少不了KEGG了。 同样的,我们从 DAVID 获取KEGG pathway的结果。 对于KEGG,我比较喜欢做气泡图,这样用两种形式的图结合在一起,效果更丰富更2023-03-04Python150
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