R语言安装第三方包的方法

Python011

R语言安装第三方包的方法,第1张

从CRAN( https://cran.r-project.org/ ) 安装第三方包的方法：

从bioconductor( http://www.bioconductor.org/ ) 安装第三方包的方法：

直接从Github( https://github.com/ ) 上直接安装第三方包的方法：

安装R包报错的问题从一开始学生信就一直存在着，但是没有专门整理一下，前两天安装 CHIPseeker 的时候实在受不了了，因为碰见了好多坑，于是在这里专门整理一下，方便自己和他人查看

到这里已经没太有耐心了，然后开始查原因，后面应该加一个 type = "binary"

再试一下

成功解决，安装 XML 时同样也是这个问题 ，跟上面是一种解决方式

安装 TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene 就不能用 biocLite 了

解决办法

解决：去 lib_PATH下把lock文件删掉

这里是 问题 5 的 参考

老版本R，在这里MARK以下

虽然讨论了一些R包安装问题，但这应（jue）该（dui）不会是我最后一次安装报错，以后再遇到会更新的

DESeq2用来处理转录组数据。那么先来完成第一步：安装。

1、传统方式安装

麻蛋，报错了！！！！为什么受伤的总是我。

2、开启查阅资料模式，然后得到的结论是这个包的安装需要利用BiocConductor或者BiocManager。

但是根据网上大神们的分享，尝试了各种方法。报错越来越多，并且越来越看不懂。

最后决定直接进入DESeq2的package官网上看吧。 https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/DESeq2.html

3、最后按照Bioconductor指示安装，成功。